● Kesi Nyingi za Miradi: tangu kuanzishwa kwake mwaka wa 2009, BMKGENE imekamilisha mamia ya miradi ya spishi katika utafiti wa GWAS ya idadi ya watu, ilisaidia watafiti kuchapisha zaidi ya makala 100, na sababu iliyojumlisha ya athari ilifikia 500.
● Wachambuzi wa kitaalamu.
● Mzunguko mfupi wa uchambuzi.
● Uchimbaji sahihi wa data.
Aina | Idadi ya Watu | Mpangilio wa mkakati na kina |
SLAF-GWAS | Nambari ya sampuli ≥200 | Ukubwa wa jenomu <400M, na ref-genome, WGS inapendekezwa |
Ukubwa wa jenomu ≤ 1G, Lebo 100K na 10X | ||
1G ≤ Ukubwa wa jenomu ≤ 2G, Lebo 200K na 10X | ||
Ukubwa wa jenomu > 2G, Lebo 300K na 10X | ||
WGS-GWAS | Nambari ya sampuli ≥200 | 10X kwa kila sampuli |
Aina tofauti, spishi ndogo, ardhi/mabenki/familia mchanganyiko/rasilimali pori
Aina tofauti, subspecies, landraces
Familia ya nusu-sib/familia kamili/rasilimali pori
● Uchanganuzi wa uhusiano wa jenomu kote
● Uchambuzi na uchunguzi wa SNP muhimu
● Ufafanuzi wa kiutendaji wa jeni la mtahiniwa
a.Phenotype QC
Histogram ya usambazaji wa mara kwa mara
Takwimu za Phenotype
b.Uchanganuzi wa ushirika (Mfano: GEMMA, Fast-LMM, EMMAX)
Mpango wa QQ
Kiwanja cha Manhattan
Mwaka | Jarida | IF | Kichwa |
2022 | NC | 17.69 | Msingi wa genomic wa giga-chromosomes na giga-genome ya mti wa peony Paeonia ostii |
2015 | NP | 7.43 | Alama za unyumba huimarisha maeneo ya jeni yenye umuhimu wa kilimo katika soya |
2018 | MP | 9.32 | Ufuataji wa jenomu zima la mkusanyiko wa ulimwenguni pote wa upatanishi wa mbegu za ubakaji unaonyesha msingi wa kijenetiki wa tofauti zao za aina ya ikolojia. |
2022 | HR | 7.29 | Uchanganuzi wa muungano wa jenomu pana hutoa maarifa ya molekuli katika tofauti asilia ya ukubwa wa mbegu ya tikiti maji |