● Mikakati mingi ya mpangilio inapatikana kwa malengo tofauti ya utafiti
● Mwenye uzoefu mkubwa wa kuunganisha genome za fangasi na zaidi ya jenomu 10,000 kamili za pene zimeunganishwa.
● Timu ya usaidizi wa kitaalamu baada ya kuuza inayotimiza mahitaji mahususi zaidi ya utafiti.
Huduma | Mkakati wa Kuratibu | Ubora umehakikishiwa | Muda uliokadiriwa wa kurejea |
Ramani nzuri ya kuvu | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | Siku 35 za kazi |
PacBio HiFi 30X | |||
Ramani kamili ya pene ya kuvu | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Uwiano wa kuunganisha kromosomu >90% | Siku 45 za kazi |
● Udhibiti wa ubora wa data ghafi
● Mkusanyiko wa jenomu
● Uchambuzi wa vipengele vya jenomu
● Dokezo la utendakazi wa jeni
● Uchanganuzi linganishi wa jeni
KwaDondoo za DNA:
Aina ya Sampuli | Kiasi | Kuzingatia | Usafi |
Dondoo za DNA | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Kwa sampuli za tishu:
Aina ya sampuli | Matibabu ya sampuli iliyopendekezwa | Sampuli ya kuhifadhi na usafirishaji |
Kuvu Unicellular | Angalia chachu chini ya darubini na uwakusanye katika awamu yao ya kielelezo Hamisha utamaduni (ulio na takriban seli 3-4.5e9) kwenye eppendorf ya 1.5 au 2 ml.(Weka kwenye barafu) Centrifuge bomba kwa dakika 1 kwa 14000 g ili kukusanya bakteria na uondoe dawa hiyo kwa uangalifu. Funga bomba na ugandishe bakteria katika nitrojeni kioevu kwa angalau h 1-3.Hifadhi bomba kwenye friji -80 ℃. | Zigandishe sampuli katika nitrojeni kioevu kwa saa 3-4 na uhifadhi katika nitrojeni kioevu au digrii -80 hadi uhifadhi wa muda mrefu.Sampuli ya usafirishaji na barafu kavu inahitajika. |
Kuvu kubwa | Tissue katika awamu ya kukua kikamilifu inapendekezwa. Osha tishu kwa maji yasiyo na endotoxin, kisha 70% ya ethonal. Hifadhi sampuli kwenye mirija ya cryo. |
1.Mchoro wa Circos juu ya vipengele vya genomic vya kuvu
2.Uchambuzi wa kulinganisha wa genomics: mti wa Phylogenetic