Chunguza uwezo wa kusoma aina pori za spishi za utafiti, zilizotolewa mfano na kesi muhimu kutoka kwa wateja wa BMKGENE.Iliyochapishwa hivi majuzi katika toleo la mwaka huu la Jarida la Bayoteknolojia ya Mimea, makala yenye kichwa “Kiwango cha Chromosome Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Muhimu Loci kwa Muinuko wa Mavuno ya Mpira” inasimama kama marejeleo muhimu.
Mti wa mpira wa Brazili (Hevea brasiliensis) unasimama kwa urefu kama chanzo kikuu cha mpira asilia.Katika karne nzima iliyopita, mbinu za kitamaduni za kuzaliana zilisababisha kuongezeka mara sita kwa uzalishaji wa mpira.Hata hivyo, msingi wa kinasaba unaohusika na uboreshaji wa mavuno ya mpira unabaki kuwa wa fumbo.
Utafiti huu ulianza kuunda jenomu ya kiwango cha kromosomu kwa mti wa mpira wa mwitu, ukitumia ushirikiano wa mpangilio wa muda mrefu wa Nanopore, ufuataji wa Illumina NGS na teknolojia ya Hi-C.
Sambamba na hilo, hifadhi ya rasilimali 147 za viini, ikijumuisha tofauti za mavuno mengi, aina za porini, na spishi zinazohusiana, ilikusanywa kwa ufuataji wa kina wa jenomu zima (WGS) kwa kutumia jukwaa la Illumina.Data iliyofuata ilifanyiwa uchanganuzi mkali wa jenetiki ya idadi ya watu, na kuwezesha mgawanyiko wa muundo wa idadi ya watu, utofauti, na ukosefu wa uwiano wa uhusiano.Uchambuzi huu unatoa mwanga juu ya tofauti za ufugaji wa ndani kati ya makundi mbalimbali.
Uchunguzi zaidi ulijumuisha uchanganuzi unaojumuisha Fst, π, Tajima's D, na LD, unaolenga kufichua mawimbi ya uteuzi yanayotokana na uboreshaji wa mavuno ya mpira, hasa ikilenga kloni za Wickham.
Kufikia kilele cha Uchanganuzi wa Muungano wa Genome-Pate (GWAS), alama zinazohusishwa na sifa za mavuno na jeni zinazohusiana na mavuno zilibainishwa.Uthibitishaji wa awali ulifichua shughuli bainifu za unukuzi katika vibadilishaji tofauti vya jeni mbili za ERF, na kutoa muhtasari wa awali wa umuhimu wao wa utendaji.Uthibitisho zaidi umepangwa ndani ya utafiti ujao.
BMKGENE inajivunia kuchangia katika mfuatano wa kina wa jenomu ya idadi hii kubwa ya watu, pamoja na jukumu kubwa katika uchanganuzi wa habari za kibayolojia.Uzoefu wetu mkubwa unajumuisha ufuataji wa NGS/TGS na uchanganuzi wa habari za kibayolojia nyingi katika safu ya spishi 1000+.Tunatazamia matarajio ya kushirikiana nawe kwenye miradi yako ijayo.
Bofya hapa ilipata maelezo zaidi kuhusu utafiti huu
Muda wa kutuma: Aug-29-2023