● Mwenye Uzoefu wa Juu: Zaidi ya sampuli 200,000 zimechakatwa katika BMK inayojumuisha aina mbalimbali za sampuli, ikiwa ni pamoja na utamaduni wa seli, tishu, maji ya mwili, n.k. na zaidi ya miradi 7,000 ya mRNA-Seq imefungwa kwa kutumia maeneo mbalimbali ya utafiti.
● Mfumo madhubuti wa udhibiti wa ubora: Viini vya udhibiti wa ubora kupitia hatua zote ikiwa ni pamoja na utayarishaji wa sampuli, utayarishaji wa maktaba, mpangilio na habari za kibayolojia ziko chini ya ufuatiliaji wa karibu ili kutoa matokeo ya ubora wa juu.
● Hifadhidata nyingi zinazopatikana kwa ufafanuzi wa utendakazi na tafiti za uboreshaji ili kutimiza malengo mbalimbali ya utafiti.
● Huduma za baada ya mauzo: Huduma za baada ya mauzo zitatumika kwa miezi 3 mradi kukamilika, ikijumuisha ufuatiliaji wa miradi, utatuzi wa matatizo, Maswali na Majibu ya matokeo, n.k.
Maktaba | Mkakati wa mpangilio | Data iliyopendekezwa | Udhibiti wa Ubora |
Poly A iliyoboreshwa | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
Conc.(ng/μl) | Kiasi (μg) | Usafi | Uadilifu |
≥ 20 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Uchafuzi wa protini au DNA umepunguzwa au haujaonyeshwa kwenye jeli. | Kwa mimea: RIN≥6.5; Kwa wanyama: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
Tishu: Uzito (kavu):≥1 g
*Kwa tishu ndogo kuliko miligramu 5, tunapendekeza kutuma sampuli ya tishu iliyogandishwa (katika nitrojeni kioevu).
Kusimamishwa kwa seli:Idadi ya seli = 3 × 106- 1 × 107
*Tunapendekeza kusafirisha lisate ya seli iliyoganda.Ikiwa seli itahesabu ndogo kuliko 5x105.
Sampuli za damu:Kiasi≥1 ml
Microorganism:Uzito ≥ 1 g
Chombo: 2 ml centrifuge tube (bati foil haifai)
Sampuli ya kuweka lebo: Kundi+ kunakili mfano A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Usafirishaji:
Bioinformatics
Eukaryotiki Mtiririko wa kazi wa uchanganuzi wa mpangilio wa mRNA
Bioinformatics
ØUdhibiti wa ubora wa data ghafi
ØRejelea mpangilio wa jenomu
ØUchambuzi wa muundo wa nakala
ØUkadiriaji wa kujieleza
ØUchambuzi wa kujieleza tofauti
ØUfafanuzi wa kazi na uboreshaji
1.mRNA Data Saturation Curve
2.Uchambuzi wa usemi tofauti-njama ya Volcano
3.Ufafanuzi wa KEGG kwenye DEGs
4.Uainishaji wa GO kwenye DEGs