BMKCloud Log in
条形 bango-03

Bidhaa

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

Upangaji wa mRNA huwezesha uwekaji wasifu wa mRNA zote zilizonakiliwa kutoka kwa seli chini ya hali mahususi.Ni teknolojia yenye nguvu ya kufichua wasifu wa usemi wa jeni, miundo ya jeni na mifumo ya molekuli ya michakato fulani ya kibiolojia.Hadi sasa, mpangilio wa mRNA umetumika sana katika utafiti wa kimsingi, uchunguzi wa kimatibabu, ukuzaji wa dawa, n.k.

Jukwaa: Jukwaa la Illumina NovaSeq


Maelezo ya Huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Onyesho

Faida

● Mwenye Uzoefu wa Juu: Zaidi ya sampuli 200,000 zimechakatwa katika BMK inayojumuisha aina mbalimbali za sampuli, ikiwa ni pamoja na utamaduni wa seli, tishu, maji ya mwili, n.k. na zaidi ya miradi 7,000 ya mRNA-Seq imefungwa kwa kutumia maeneo mbalimbali ya utafiti.

● Mfumo madhubuti wa udhibiti wa ubora: Viini vya udhibiti wa ubora kupitia hatua zote ikiwa ni pamoja na utayarishaji wa sampuli, utayarishaji wa maktaba, mpangilio na habari za kibayolojia ziko chini ya ufuatiliaji wa karibu ili kutoa matokeo ya ubora wa juu.

● Hifadhidata nyingi zinazopatikana kwa ufafanuzi wa utendakazi na tafiti za uboreshaji ili kutimiza malengo mbalimbali ya utafiti.

● Huduma za baada ya mauzo: Huduma za baada ya mauzo zitatumika kwa miezi 3 mradi kukamilika, ikijumuisha ufuatiliaji wa miradi, utatuzi wa matatizo, Maswali na Majibu ya matokeo, n.k.

Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji

Maktaba Mkakati wa mpangilio Data iliyopendekezwa Udhibiti wa Ubora
Poly A iliyoboreshwa Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Mahitaji ya Sampuli:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Kiasi (μg)

Usafi

Uadilifu

≥ 20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Uchafuzi wa protini au DNA umepunguzwa au haujaonyeshwa kwenye jeli.

Kwa mimea: RIN≥6.5;

Kwa wanyama: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

mwinuko mdogo au hakuna msingi

Tishu: Uzito (kavu):≥1 g
*Kwa tishu ndogo kuliko miligramu 5, tunapendekeza kutuma sampuli ya tishu iliyogandishwa (katika nitrojeni kioevu).

Kusimamishwa kwa seli:Idadi ya seli = 3 × 106- 1 × 107
*Tunapendekeza kusafirisha lisate ya seli iliyoganda.Ikiwa seli itahesabu ndogo kuliko 5x105.

Sampuli za damu:Kiasi≥1 ml

Microorganism:Uzito ≥ 1 g

Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa

Chombo: 2 ml centrifuge tube (bati foil haifai)

Sampuli ya kuweka lebo: Kundi+ kunakili mfano A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Usafirishaji:

  1. Barafu kavu: Sampuli zinahitaji kuingizwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
  2. Mirija ya RNAstable: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye mirija ya kusawazisha ya RNA (km RNAstable®) na kusafirishwa katika halijoto ya kawaida.

Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Sampuli ya QC

Muundo wa majaribio

utoaji wa sampuli

Utoaji wa sampuli

Jaribio la majaribio

Uchimbaji wa RNA

Maandalizi ya Maktaba

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Uchambuzi wa data

Huduma za Baada ya Uuzaji

Huduma za baada ya kuuza


  • Iliyotangulia:
  • Inayofuata:

  • Bioinformatics

    wps_doc_10

    Eukaryotiki Mtiririko wa kazi wa uchanganuzi wa mpangilio wa mRNA

    Bioinformatics

    ØUdhibiti wa ubora wa data ghafi

    ØRejelea mpangilio wa jenomu

    ØUchambuzi wa muundo wa nakala

    ØUkadiriaji wa kujieleza

    ØUchambuzi wa kujieleza tofauti

    ØUfafanuzi wa kazi na uboreshaji

    1.mRNA Data Saturation Curve

    3(1)

    2.Uchambuzi wa usemi tofauti-njama ya Volcano

    4(1)

    3.Ufafanuzi wa KEGG kwenye DEGs

    5(1)

    4.Uainishaji wa GO kwenye DEGs

    6(1)

    pata nukuu

    Andika ujumbe wako hapa na ututumie

    Tutumie ujumbe wako: