●Majukwaa:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten na BGI-DNB-T7
●Njia za mpangilio:PE50, PE100, PE150, PE250
●Udhibiti wa ubora wa maktaba kabla ya mpangilio
●Mpangilio wa utoaji wa data na QC:utoaji wa ripoti ya QC na data mbichi katika umbizo la fastq baada ya kutenganisha na kuchuja usomaji wa Q30.
●Usawa wa huduma za mpangilio:mteja anaweza kuchagua kufululiza kwa njia, mtiririko wa seli au kiasi cha data.
●Usawa wa majukwaa:Maktaba za DNB zinaweza kuhamishiwa kwenye majukwaa ya Illumina
●Uzoefu wa kina kwenye jukwaa la mpangilio la Illumina:na maelfu ya miradi iliyofungwa yenye aina mbalimbali.
●Uwasilishaji wa ripoti ya mpangilio wa QC:na vipimo vya ubora, usahihi wa data na utendaji wa jumla wa mradi wa mpangilio.
●Mchakato wa mpangilio wa watu wazima:na muda mfupi wa kuzunguka.
●Udhibiti Madhubuti wa Ubora: tunatekeleza mahitaji madhubuti ya QC ili kuhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa juu mfululizo.
Kiasi cha data (X) | Kuzingatia (qPCR/nM) | Kiasi |
X ≤ Gb 50 | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
Gb 50 ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Jukwaa | Kuzingatia (qPCR/nM) | Kiasi |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
Mbali na mkusanyiko na kiasi cha jumla, muundo unaofaa wa kilele pia unahitajika.
Ripoti juu ya ubora wa maktaba hutolewa kabla ya kupanga, kutathmini kiasi cha maktaba, na kugawanyika.
Jedwali 1. Takwimu za mpangilio wa data.
Kitambulisho cha mfano | BMKID | Inasoma ghafi | Data Ghafi (bp) | Usomaji safi (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Kielelezo 1. Usambazaji wa ubora pamoja na usomaji katika kila sampuli
Kielelezo 2. Usambazaji wa maudhui ya msingi
Kielelezo 3. Usambazaji wa yaliyomo katika mlolongo wa data