-
Enkelkärniga RNA-sekvensering
Framstegen inom encellsfångande och individuell bibliotekskonstruktionsteknik i kombination med högkapacitetssekvensering möjliggör genuttrycksstudier på cell-för-cell-basis.Det möjliggör en djupare och komplett systemanalys av komplexa cellpopulationer, där den i stort sett undviker att maskera deras heterogenitet genom att ta medelvärdet av alla celler.
Vissa celler är dock inte lämpliga att göra om till encellssuspension, så andra provberedningsmetoder – kärnextraktion från vävnader behövs, det vill säga kärnan extraheras direkt från vävnader eller cell och prepareras till enkärnssuspension för enkel- cellsekvensering.
BMK tillhandahåller 10× Genomics ChromiumTM-baserad encellig RNA-sekvenseringstjänst.Denna tjänst har använts i stor utsträckning i studier av sjukdomsrelaterade studier, såsom immuncellsdifferentiering, tumörheterogenitet, vävnadsutveckling, etc.
Spatiellt transkriptomchip: 10× Genomics
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics står i spetsen för vetenskaplig innovation, vilket ger forskare möjlighet att fördjupa sig i komplicerade genuttrycksmönster i vävnader samtidigt som deras rumsliga kontext bevaras.Bland olika plattformar har BMKGene utvecklat BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, med ettförbättrad upplösningpå 5 µM, når det subcellulära området och möjliggörinställningar för flernivåupplösning.S1000-chippet, med cirka 2 miljoner fläckar, använder mikrobrunnar skiktade med pärlor laddade med rumsligt streckkodade infångningssonder.Ett cDNA-bibliotek, berikat med rumsliga streckkoder, förbereds från S1000-chippet och sekvenseras därefter på Illumina NovaSeq-plattformen.Kombinationen av rumsligt streckkodade prover och UMI:er säkerställer noggrannheten och specificiteten hos de genererade data.BMKManu S1000-chipets unika egenskap ligger i dess mångsidighet, som erbjuder upplösningsinställningar på flera nivåer som kan finjusteras till olika vävnader och detaljnivåer.Denna anpassningsförmåga positionerar chippet som ett enastående val för olika rumsliga transkriptomiska studier, vilket säkerställer exakt rumslig klustring med minimalt brus.
Med hjälp av BMKManu S1000-chippet och andra spatial transcriptomics-teknologier kan forskare få en bättre förståelse för den rumsliga organisationen av celler och de komplexa molekylära interaktioner som sker inom vävnader, vilket ger ovärderliga insikter i de mekanismer som ligger bakom biologiska processer inom ett brett spektrum av områden, inklusive onkologi, neurovetenskap, utvecklingsbiologi, immunologi och botaniska studier.
Plattform: BMKManu S1000-chip och Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics är en banbrytande teknologi som gör det möjligt för forskare att undersöka genuttrycksmönster i vävnader samtidigt som de bevarar deras rumsliga kontext.En kraftfull plattform inom denna domän är 10x Genomics Visium i kombination med Illumina-sekvensering.Principen för 10X Visium ligger på ett specialiserat chip med ett avsett infångningsområde där vävnadssnitt placeras.Detta fångstområde innehåller streckkodade fläckar, som var och en motsvarar en unik rumslig plats i vävnaden.De fångade RNA-molekylerna från vävnaden märks sedan med unika molekylära identifierare (UMI) under den omvända transkriptionsprocessen.Dessa streckkodade fläckar och UMI: er möjliggör exakt rumslig kartläggning och kvantifiering av genuttryck vid en encellsupplösning.Kombinationen av rumsligt streckkodade prover och UMI:er säkerställer noggrannheten och specificiteten hos de genererade data.Genom att använda denna Spatial Transcriptomics-teknologi kan forskare få en djupare förståelse för den rumsliga organisationen av celler och de komplexa molekylära interaktionerna som förekommer inom vävnader, vilket ger ovärderliga insikter i de mekanismer som ligger bakom biologiska processer inom flera områden, inklusive onkologi, neurovetenskap, utvecklingsbiologi, immunologi och botaniska studier.
Plattform: 10X Genomics Visium och Illumina NovaSeq
