-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq tillhandahåller genomomfattande profilering av DNA-mål för histonmodifiering, transkriptionsfaktorer och andra DNA-associerade proteiner.Den kombinerar selektiviteten hos kromatinimmunoutfällning (ChIP) för att återvinna specifika protein-DNA-komplex, med kraften hos nästa generations sekvensering (NGS) för sekvensering med hög genomströmning av det återvunna DNA:t.Dessutom, eftersom protein-DNA-komplexen återvinns från levande celler, kan bindningsställen jämföras i olika celltyper och vävnader, eller under olika förhållanden.Tillämpningar sträcker sig från transkriptionsreglering till utvecklingsvägar till sjukdomsmekanismer och vidare.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Metagenomisk sekvensering -NGS
Metagenom hänvisar till en samling av totalt genetiskt material från en blandad gemenskap av organismer, såsom miljömetagenom, mänskligt metagenom, etc. Det innehåller genom från både odlingsbara och oodlingsbara mikroorganismer.Metagenomisk sekvensering är ett molekylärt verktyg som används för att analysera de blandade genomiska materialen som extraheras från miljöprover, vilket ger detaljerad information om arternas mångfald och överflöd, populationsstruktur, fylogenetisk relation, funktionella gener och korrelationsnätverk med miljöfaktorer.
Plattform:Illumina NovaSeq-plattformen
-
Metagenomisk sekvensering-Nanopore
Metagenomics är ett molekylärt verktyg som används för att analysera de blandade genomiska materialen som extraherats från miljöprover, vilket ger detaljerad information om arternas mångfald och överflöd, populationsstruktur, fylogenetisk relation, funktionella gener och korrelationsnätverk med miljöfaktorer, etc. Nanopore-sekvenseringsplattformar har nyligen introducerats till metagenomiska studier.Dess enastående prestanda i läslängd förbättrade till stor del nedströms metagenomisk analys, särskilt metagenommontering.Genom att dra fördelar av läslängden kan Nanopore-baserad metagenomisk studie uppnå mer kontinuerlig montering jämfört med hagelgevärsmetagenomik.Det har publicerats att Nanopore-baserad metagenomik framgångsrikt genererade kompletta och slutna bakteriegenom från mikrobiomer (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Plattform:Nanopore PromethION P48
-
Helgenom-bisulfitsekvensering
DNA-metylering vid den femte positionen i cytosin (5-mC) har en fundamental inverkan på genuttryck och cellulär aktivitet.Onormala metyleringsmönster har associerats med flera tillstånd och sjukdomar, såsom cancer.WGBS har blivit guldstandarden för att studera genomomfattande metylering vid enkelbasupplösning.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Analys för transposas-tillgängligt kromatin med hög genomströmningssekvensering (ATAC-seq)
ATAC-seq är en sekvenseringsmetod med hög genomströmning för analys av genomomfattande kromatintillgänglighet, vilket är viktigt för global epigenetisk kontroll av genuttryck.Sekvenseringsadaptrar sätts in i öppna kromatinregioner genom hyperaktivt Tn5-transposas.Efter PCR-amplifiering konstrueras ett sekvenseringsbibliotek.Alla de öppna kromatinregionerna kan erhållas under ett specifikt rum-tidsförhållande, inte bara begränsat till bindningsställena för en transkriptionsfaktor eller en viss histonmodifierad region.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subenheten på 16S och 18S rRNA som innehåller både mycket konserverade och hypervariabla regioner är ett perfekt molekylärt fingeravtryck för identifiering av prokaryota och eukaryota organismer.Genom att dra fördel av sekvensering kan dessa amplikoner riktas mot de konserverade delarna och de hypervariabla regionerna kan helt karakteriseras för mikrobiell identifiering, vilket bidrar till studier som täcker analys av mikrobiell mångfald, taxonomi, fylogeni, etc. Single-molecule realtime (SMRT) ) sekvensering av PacBio-plattformen möjliggör erhållande av mycket exakta långa avläsningar, som kan täcka amplikoner i full längd (ca 1,5 Kb).Den vidgade synen på genetiskt fält förbättrade avsevärt upplösningen i artanteckningar i bakterier eller svampar.
Plattform:PacBio uppföljare II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikonsekvensering syftar till att avslöja fylogeni, taxonomi och artöverflöd i ett mikrobiellt samhälle genom att undersöka PCR-produkter från hushållningsgenetiska markörer som innehåller både mycket konverserade och hypervariabla delar.Införandet av dessa perfekta molekylära fingeravtryck av Woeses et al, (1977) möjliggör isoleringsfri mikrobiomprofilering.Sekvensering av 16S (bakterier), 18S (svampar) och Internt transkriberad spacer (ITS, svampar) möjliggör identifiering av både rikliga arter såväl som sällsynta och oidentifierade arter.Denna teknik har blivit ett allmänt tillämpat och viktigt verktyg för att identifiera differentiell mikrobiell sammansättning i olika miljöer, såsom mänsklig mun, tarmar, avföring, etc.
Plattform:Illumina NovaSeq-plattformen
-
Omsekvensering av hela genomet av bakterier och svampar
Omsekvensering av hela genomet av bakterier och svampar är ett viktigt verktyg för att komplettera genomen från kända bakterier och svampar, samt för att jämföra flera genom eller för att kartlägga genom från nya organismer.Det är av stor vikt att sekvensera hela genom av bakterier och svampar för att generera korrekta referensgenom, för att göra mikrobiell identifiering och andra jämförande genomstudier.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
PacBio-fullängds 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S/18S/ITS) plattform är utvecklad med många års erfarenhet av mikrobiell mångfaldsprojektanalys, som innehåller standardiserad grundläggande analys och personlig analys: grundläggande analys täcker det vanliga analysinnehållet i aktuell mikrobiell forskning, analysinnehållet är rikt och omfattande, och analysresultat presenteras i form av projektrapporter;Innehållet i personlig analys är mångsidigt.Prover kan väljas och parametrar kan ställas in flexibelt i enlighet med den grundläggande analysrapporten och forskningssyfte, för att realisera personliga krav.Windows operativsystem, enkelt och snabbt.
-
PacBio-fullängdstranskriptom (icke-referens)
Med Pacific Biosciences (PacBio) Isoform-sekvenseringsdata som indata, kan den här appen identifiera transkriptionssekvenser i full längd (utan montering).Genom att kartlägga fullängdssekvenser mot referensgenom kan transkript optimeras av kända gener, transkript, kodande regioner, etc. I detta fall kan mer exakt identifiering av mRNA-strukturer, såsom alternativ splitsning, etc, uppnås.Gemensam analys med NGS-transkriptomsekvenseringsdata möjliggör mer omfattande annotering och mer exakt kvantifiering av uttryck på transkriptnivå, vilket till stor del gynnar nedströms differentiellt uttryck och funktionell analys.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
DNA-metyleringsforskning har alltid varit ett hett ämne inom sjukdomsforskningen och är nära relaterad till genuttryck och fenotypiska egenskaper.RRBS är en noggrann, effektiv och ekonomisk metod för DNA-metyleringsforskning.Anrikning av promotor- och CpG-öregioner genom enzymatisk klyvning (Msp I), kombinerat med Bisulfite-sekvensering, ger högupplöst DNA-metyleringsdetektion.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Prokaryotisk mRNA-sekvensering
mRNA-sekvensering möjliggör en omfattande profilering av alla mRNA-transkript i celler under specifika förhållanden.Denna banbrytande teknologi fungerar som ett kraftfullt verktyg som avslöjar invecklade genuttrycksprofiler, genstrukturer och molekylära mekanismer förknippade med olika biologiska processer.MRNA-sekvensering, som är allmänt antagen inom grundforskning, klinisk diagnostik och läkemedelsutveckling, ger insikter om invecklad celldynamik och genetisk reglering.Vår prokaryota mRNA-provbearbetning är skräddarsydd för prokaryota transkriptom, som involverar rRNA-utarmning och riktningsbiblioteksförberedelser.
Plattform: Illumina NovaSeq X
