-
PacBio-fullängds 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S/18S/ITS) plattform är utvecklad med många års erfarenhet av mikrobiell mångfaldsprojektanalys, som innehåller standardiserad grundläggande analys och personlig analys: grundläggande analys täcker det vanliga analysinnehållet i aktuell mikrobiell forskning, analysinnehållet är rikt och omfattande, och analysresultat presenteras i form av projektrapporter;Innehållet i personlig analys är mångsidigt.Prover kan väljas och parametrar kan ställas in flexibelt i enlighet med den grundläggande analysrapporten och forskningssyfte, för att realisera personliga krav.Windows operativsystem, enkelt och snabbt.
-
PacBio-fullängdstranskriptom (icke-referens)
Med Pacific Biosciences (PacBio) Isoform-sekvenseringsdata som indata, kan den här appen identifiera transkriptionssekvenser i full längd (utan montering).Genom att kartlägga fullängdssekvenser mot referensgenom kan transkript optimeras av kända gener, transkript, kodande regioner, etc. I detta fall kan mer exakt identifiering av mRNA-strukturer, såsom alternativ splitsning, etc, uppnås.Gemensam analys med NGS-transkriptomsekvenseringsdata möjliggör mer omfattande annotering och mer exakt kvantifiering av uttryck på transkriptnivå, vilket till stor del gynnar nedströms differentiellt uttryck och funktionell analys.
-
Verktygssatser
BMKCloud är en ledande bioinformatisk plattform som tillhandahåller en enda lösning för genomiska program, som är brett förtroende för forskare inom olika arenor, inklusive medicinsk, jordbruk, miljö, etc. BMKCloud har åtagit sig att tillhandahålla integrerade, pålitliga och effektiva tjänster inklusive bioinformatiska analysplattformar och verktyg , datorresurser, offentlig databas, bioinformtiska onlinekurser, etc. BMKCloud har olika ofta använda bioinformatiska verktyg som inkluderar genkommentarer, evolutionära genetiska verktyg, ncRNA, datakvalitetskontroll, montering, anpassning, dataextraktion, mutationer, statistik, figurgenerator, sekvens analys osv.
-
litet RNA
Små RNA är en typ av kort icke-kodande RNA med en genomsnittlig längd på 18-30 nt, inklusive miRNA, siRNA och piRNA.Dessa små RNA har massivt rapporterats vara involverade i olika biologiska processer såsom mRNA-nedbrytning, translationsinhibering, heterokromatinbildning, etc. SmallRNA-sekvenseringsanalys har använts i stor utsträckning i studier om djur-/växtutveckling, sjukdomar, virus etc. Litet RNA sekvensanalysplattform består av standardanalys och avancerad datautvinning.På basen av RNA-seq-data kan standardanalys uppnå miRNA-identifiering och -förutsägelse, miRNA-målgenförutsägelse, antecknings- och uttrycksanalys.Avancerad analys möjliggör skräddarsydd miRNA-sökning och extraktion, generering av Venn-diagram, nätverksbyggande av miRNA och målgen.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS är en analysplattform för omsekvensering av hela genomet, som är utvecklad på basen av rik erfarenhet av Biomarker Technologies.Denna lättanvända plattform tillåter snabb inlämning av ett integrerat analysarbetsflöde genom att helt enkelt ställa in några grundläggande parametrar, som passar för DNA-sekvenseringsdata som genereras från både Illumina-plattformen och BGI-sekvenseringsplattformen.Denna plattform är utplacerad på högpresterande datorserver, vilket möjliggör mycket effektiv dataanalys på mycket begränsad tid.Personlig datautvinning är tillgänglig på basen av standardanalys, inklusive muterad genfråga, PCR-primerdesign, etc.
-
mRNA (referens)
Transkriptom är länken mellan genomisk genetisk information och proteomet för biologisk funktion.Transkriptionsnivåreglering är det viktigaste och mest studerade regleringssättet för organismer.Transkriptomsekvensering kan sekvensera transkriptomet vid vilken tidpunkt som helst eller under alla förhållanden, med en upplösning som är exakt för en enskild nukleotid. Den kan dynamiskt återspegla nivån av gentranskription, samtidigt identifiera och kvantifiera sällsynta och normala transkript, och tillhandahålla den strukturella informationen om provspecifika avskrifter.
För närvarande har transkriptomsekvenseringsteknologi använts i stor utsträckning inom agronomi, medicin och andra forskningsområden, inklusive reglering av djur- och växtutveckling, miljöanpassning, immuninteraktion, genlokalisering, genetisk utveckling av arter och upptäckt av tumörer och genetiska sjukdomar.
-
Metagenomics (NGS)
Denna analysplattform är designad för metagenomisk dataanalys med hagelgevär baserat på många års erfarenhet.Det består av ett integrerat arbetsflöde som innehåller olika vanliga metagenomiska analyser, inklusive databehandling, studier på artnivå, studier på genfunktionsnivå, metagenombinning, etc. Dessutom finns anpassade datautvinningsverktyg tillgängliga på standardanalysarbetsflöden, inklusive gen- och artförfrågan , parameterinställning, personlig figurgenerering, etc.
-
LncRNA
Långa icke-kodande RNA (lncRNA) är en typ av transkript med längd längre än 200 nt, som inte kan koda proteiner.Ackumulativa bevis tyder på att de flesta lncRNA är mycket sannolikt att vara funktionella.Högkapacitetssekvenseringsteknologier och bioinformatiska analysverktyg ger oss möjlighet att avslöja lncRNA-sekvenser och positioneringsinformation mer effektivt och leder oss att upptäcka lncRNA med avgörande regulatoriska funktioner.BMKCloud är stolta över att tillhandahålla våra kunder lncRNA-sekvensanalysplattform för att uppnå snabb, pålitlig och flexibel lncRNA-analys.
-
GWAS
Genomomfattande associationsstudie (GWAS) syftar till att identifiera genetiska varianter (genotyp) som förknippas med specifika egenskaper (fenotyp).GWA-studier undersöker genetiska markörer som korsar hela genomet hos ett stort antal individer och förutsäger genotyp-fenotypassociationer genom statistisk analys på populationsnivå.Helgenomsekvensering kan potentiellt upptäcka alla genetiska varianter.Tillsammans med fenotypiska data kan GWAS bearbetas för att identifiera fenotyprelaterade SNPs, QTLs och kandidatgener, vilket starkt backar upp modern djur-/växtförädling.SLAF är en egenutvecklad förenklad genomsekvenseringsstrategi, som upptäcker genomomfattande distribuerade markörer, SNP.Dessa SNP, som molekylärgenetiska markörer, kan bearbetas för associationsstudier med riktade egenskaper.Det är en kostnadseffektiv strategi för att identifiera komplexa egenskaper associerade genetiska variationer.
-
Nanopore Transkriptomik i full längd
Komplexa och variabla alternativa isoformer i organismer är viktiga genetiska mekanismer för att reglera genuttryck och proteindiversitet.Noggrann identifiering av transkriptstrukturer är grunden för djupgående studier av genuttrycksregleringsmönster.Nanopore sekvenseringsplattform har framgångsrikt fört transkriptomisk studie till isoform-nivå.Denna analysplattform är utformad för att analysera RNA-Seq-data som genereras på Nanopore-plattformen på basen av referensgenomet, vilket uppnår kvalitativa och kvantitativa analyser på både gennivå och transkriptnivå.
-
circ-RNA
Cirkulärt RNA(circRNA) är en typ av icke-kodande RNA, som nyligen har visat sig spela en avgörande roll i regulatoriska nätverk involverade i utveckling, miljöresistens, etc. Skiljer sig från linjära RNA-molekyler, t.ex. mRNA, lncRNA, 3' och 5' ändarna av circRNA är sammanfogade för att bilda en cirkulär struktur, som räddar dem från nedbrytning av exonukleas och är mer stabila än de flesta linjära RNA.CircRNA har visat sig ha olika funktioner för att reglera genuttryck.CircRNA kan fungera som ceRNA, som binder miRNA konkurrenskraftigt, känd som miRNA-svamp.CircRNA sekvenseringsanalysplattform ger circRNA struktur och uttrycksanalys, målförutsägelse och gemensam analys med andra typer av RNA-molekyler
-
BSA
Bulked Segregant Analysis-plattformen består av standardanalys i ett steg och avancerad analys med anpassad parameterinställning.BSA är en teknik som används för att snabbt identifiera fenotypassocierade genetiska markörer.Huvudarbetsflödet för BSA innehåller: 1. välja två grupper av individer med extremt motsatta fenotyper;2. sammanslagning av DNA, RNA eller SLAF-seq (utvecklad av Biomarker) från alla individer för att bilda två bulk av DNA;3. identifiera differentiella sekvenser mot referensgenom eller däremellan, 4. förutsäga kandidatlänkade regioner genom ED och SNP-indexalgoritm;5. Funktionsanalys och anrikning av gener i kandidatregioner, etc. Mer avancerad brytning av data inklusive genetisk markörscreening och primerdesign finns också tillgängliga.
