Prestanda för olika sekvenseringstekniker för att lösa metagenomik.
I den här föreläsningen ger hon en introduktion om tillämpningarna av olika sekvenseringsteknologier för att förstå mikrobiom, inklusive deras tekniska arbetsflöden, prestanda och några fallstudier.Föredraget kommer att behandla följande aspekter:
● Allmän introduktion om aktuella mikrobiomprofileringsmetoder
● Amplikonbaserad metabarcoding-sekvensering: Från provberedning till datatolkning
● Vad mer vi kan förvänta oss av metabarcoding: PacBio-baserad amplikonsekvensering i full längd
● Hagelgevärs metagenomsekvensering för en mer heltäckande bild av funktionella gener
● Nanopore-baserad metagenomsekvensering