Höjdpunkter
I detta två timmar långa webbseminarium är det vår stora ära att ha bjudit in sex experter inom grödgenomik.Våra talare kommer att ge en djupgående tolkning av två genomiska studier av Rye, som nyligen publicerades påNaturgenetik:
1. Genomsammansättning i kromosomskala ger insikter i rågbiologi, evolution och agronomisk potential
2. En genomsamling av hög kvalitet framhäver rågens genomiska egenskaper och agronomiskt viktiga gener
Vi är också glada över att ha en senior FoU-forskare från Biomarker Technologies för att dela med sig av sin erfarenhet av de novo-genommontering.
Dagordning
09:00 CET
Välkomstkommentarer
Zheng Hong-kun
Grundare och VD Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15
Förbättring av råg-, rågvete- och veteförbättring genom att använda högkvalitativ referensgenomsekvens
I detta webbseminarium gav Prof. Wang oss en övergripande uppdatering av den aktuella statusen för triticeae-genomforskning och visade framgången och genombrotten för de två enastående arbetena om råggenomstudier, som nyligen publicerades på Nature Genetics och introducerar hela forskningen grupper som leder och bidrar i arbetet.
09:25
Cereal genomics @ IPK Gatersleben
Spannmålsgräs från Triticeae-stammen har varit en viktig födokälla i tempererade områden, som länge har betraktats som en hotspot för förbättring och förädling av grödor.Bland alla odlade arter är denna stam känd för sina extremt komplexa genomiska egenskaper inklusive stora genomstorlekar, höga halter av TE, polyploidi, etc. Under denna session gav Prof. Nils Stein oss en övergripande introduktion om IPK Gatersleben och aktuell status för spannmål. genomic research@IPK Gatersleben.
09:35
Genomsammansättning i kromosomskala ger insikter i rågbiologi, evolution och agronomisk potential
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Råg (Secale cereale L.) är en exceptionellt klimattålig spannmålsgröda, som används flitigt för att producera förbättrade vetesorter via introgressiv hybridisering, och som besitter hela repertoaren av gener som krävs för att möjliggöra hybridförädling.Råg är allogam och först nyligen domesticerad, vilket ger odlade råg tillgång till en mångsidig och exploateringsbar vilda genpool.För att ytterligare förbättra rågens agronomiska potential producerade vi en kromosomskala kommenterad sammansättning av 7,9 Mbp råggenomet och validerade omfattande dess kvalitet med hjälp av en uppsättning molekylärgenetiska resurser.Vi visar tillämpningar av denna resurs med ett brett utbud av undersökningar.Vi presenterar fynd om odlad rågs ofullständiga genetiska isolering från vilda släktingar, mekanismer för genomets strukturella evolution, patogenresistens, lågtemperaturtolerans, fertilitetskontrollsystem för hybriduppfödning och avkastningsfördelarna med råg-vete-introgressioner.
10:05
En genomsamling av hög kvalitet framhäver rågens genomiska egenskaper och agronomiskt viktiga gener
Råg är en värdefull mat- och fodergröda, en viktig genetisk resurs för förbättring av vete och rågvete, och ett oumbärligt material för effektiva jämförande genomikstudier i gräs.Här sekvenserade vi genomet av Weining råg, en elit kinesisk rågsort.De sammansatta kontigerna (7,74 Gb) stod för 98,47% av den uppskattade genomstorleken (7,86 Gb), med 93,67% av contigerna (7,25 Gb) tilldelade sju kromosomer.Repetitiva element utgjorde 90,31% av det sammansatta genomet.Jämfört med tidigare sekvenserade Triticeae-genom, visade Daniela, Sumaya och Sumana retrotransposoner stark expansion i råg.Ytterligare analyser av Weining-sammansättningen kastar nytt ljus över genomomfattande genduplikationer och deras inverkan på stärkelsebiosyntesgener, fysiska organisationer av komplexa prolaminloki, genuttrycksegenskaper som ligger bakom tidig rubrikdrag och förmodade domesticeringsassocierade kromosomala regioner och loci i råg.Denna genomsekvens lovar att påskynda genomik och förädlingsstudier av råg och relaterade spannmålsgrödor.
10:35
Utmaningar, lösningar och framtid för genom de novo montering
Genom av hög kvalitet är grunden för genomiska studier.Även om den snabba utvecklingen inom sekvensering och algoritm har möjliggjort en mycket enklare och effektivare genommontering, ökar också kraven på monteringsnoggrannhet och fullständighet i takt med att forskningsmålen fördjupas.I det här föredraget kommer jag att diskutera de aktuella populära teknologierna inom genomsamling med flera framgångsrika fall och ta en glimt av den framtida utvecklingen.
Posttid: Jan-08-2022