GENOMEVOLUTION
Genomet av Nautilus pompilius belyser ögats evolution och biomineralisering
PacBio-sekvensering |Illumina |Fylogenetisk analys |RNA-sekvensering |SEM |Proteomics
I den här studien tillhandahöll Biomarker Technologies tjänster för PacBio-sekvensering, NGS-sekvensering och RNA-sekvensering, samt tekniskt stöd för genomsamling och bioinformatisk analys av sekvenseringsdata.
Abstrakt
Nautilus är den enda överlevande exteriört skalade bläckfisken från paleozoikum.Det är unikt inom bläckfisksläktet och avgörande för att förstå de evolutionära nyheterna hos bläckfiskar.Här presenterar vi en komplettNautilus pompiliusgenomet som en grundläggande genomisk referens för innovationer av bläckfisk, såsom pinhole eye och biomineralisering.Nautilus visar ett kompakt, minimalistiskt genom med få kodande gener och långsamma evolutionära hastigheter i både icke-kodande och kodande regioner bland kända bläckfiskar.Viktigt är att flera genomiska innovationer inklusive genförluster, oberoende sammandragning och expansion av specifika genfamiljer och deras associerade regulatoriska nätverk sannolikt formade utvecklingen av nautilus pinhole eye.Den konserverade blötdjursbiomineraliseringsverktyget och härstamningsspecifika repetitiva domäner med låg komplexitet är viktiga för konstruktionen av nautilusskalet.Nautilus-genomet utgör en värdefull resurs för att rekonstruera de evolutionära scenarier och genomiska innovationer som formar de befintliga bläckfiskarna.
Nyheter och höjdpunkter syftar till att dela de senaste framgångsrika fallen med Biomarker Technologies, fånga nya vetenskapliga landvinningar såväl som framstående tekniker som tillämpas under studien.
Posttid: 2022-05-05