MIKROBIAL
Bakteriekompatibilitet och immobilisering med biokol förbättrad nedbrytning av tebukonazol, jordmikrobiomsammansättning och funktion
Fullängds 16S amplikonsekvensering |PacBio HiFi |Alfa mångfald |Beta-mångfald
I denna studie tillhandahölls fullängds 16S amplikonsekvensering av PacBio och bioinformatisk analys av Biomarker Technologies.
Höjdpunkter
Biokol immobiliserade tebukonazol-nedbrytande bakterier Alcaligenes faecalis WZ-2 studerades på biologisk nedbrytningseffektivitet och effekter på tebukonazolförorenad jord i jämförelse med fri nedbrytande stam WZ-2.
1. Biokol-immobiliserad WZ-2 visade en mer effektiv nedbrytning i tebukonazol jämfört med fri WZ-2 genom att reducera halveringstiden för tebukonazol i jord från 18,7 dagar till 13,3 dagar.
2. Biokol-immobiliserad WZ-2 kunde återställa naturliga markmikrobiella enzymaktiviteter, inklusive ureas, dehydrogenas och invertas, etc.
3. Mikrobiell profil i biokol-immobiliserad WZ-2-behandlad jord bestämd genom fullängds 16S-sekvensering stödde starkt att detta system kunde återställa markens hälsa genom att förbättra bakteriesamhällets struktur under tebukonazolkontamination.
Experiment (sekvensrelaterat)
Gruppering: CK: Naturlig jord;T: Jord spetsad med tebukonazol;S: Tebukonazol innehöll jord med fri stam WZ-2;BC: Tebukonazol innehöll jord med biokol;BCS: Tebukonazol innehöll jord med biokol immobiliserat WZ-2.
Provtagning: Total jord-DNA-extraktion amplifierad med 16S rDNA-primrar
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') och 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),representerande fullängds 16S rDNA
Sekvenseringsplattform: PacBio RS II
Sekvenseringsstrategi: CCS HIFI läser
Dataanalys:BMKCloudBioinformatisk plattform gör guldfisk till ett utmärkt genetiskt modellsystem för fiskens fysiologi och evolution.
Resultat
Jordens mikrobiell gemenskapsstruktur bestämdes genom 16S rDNA-sekvensering.OTU-rikedom och alfa-diversitetsindex, inklusive Chao1, Ace, Shannon och Simpson-index utvärderades för att avslöja arternas mångfald i varje system.Efter 60 dagars inkubation visade alla index liknande trend, dvs tebukonazol kunde inducera minskning av artrikedom och mångfald i jord.Men genom att lägga till stam WZ-2, återvanns markbakterier delvis i termer av både rikedom och mångfald.Begränsad skillnad observerades mellan BC, BCS och CK, vilket tyder på att biokol och biokol-immobiliserat WZ-2 effektivt kan återställa jordens biologiska hälsa.
Oviktad pargruppsmetod med aritmetiska medelvärden (UPGMA) användes i denna studie för att visa beta-mångfald mellan grupper.Som visas i följande figur, delade BC, BSC och CK mer liknande mönster av mikrobiell sammansättning jämfört med grupp T och S, vilket ytterligare indikerade att införande av biokol i tebukonazolförorenad markbiosanering till stor del kan underlätta återhämtningen av mikrobiell gemenskap i marken.
Figur.UPGMA-klustring av bakteriesamhället på filumnivå under olika behandling
Referens
Sun, Tong, et al."Bakteriell kompatibilitet och immobilisering med biokol förbättrade nedbrytning av tebukonazol, jordmikrobiomsammansättning och funktion."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Nyheter och höjdpunkter syftar till att dela de senaste framgångsrika fallen med Biomarker Technologies, fånga nya vetenskapliga landvinningar såväl som framstående tekniker som tillämpas under studien.
Posttid: Jan-08-2022