Genomomfattande associationsanalys
1. Servicefördelar
● Rikliga projektfall: sedan starten 2009 har BMKGENE slutfört hundratals artprojekt inom populations-GWAS-forskning, hjälpt forskare att publicera mer än 100 artiklar och den kumulativa effektfaktorn nådde 500.
● Professionella analytiker.
● Kort analyscykel.
● Exakt datautvinning.
2. Servicespecifikationer
| Typ | Befolkningsskala | Sekvenseringsstrategi och djup |
| SLAF-GWAS | Provnummer ≥200 | Genomstorlek <400M, med ref-genom, WGS rekommenderas |
| Genomstorlek ≤ 1G, 100K Taggar och 10X | ||
| 1G ≤ Genomstorlek ≤ 2G, 200K-taggar och 10X | ||
| Genomstorlek > 2G, 300K-taggar och 10X | ||
| WGS-GWAS | Provnummer ≥200 | 10X för varje prov |
3. Materialval
Olika sorter, underarter, lantraser/genbanker/blandade familjer/vilda resurser
Olika sorter, underarter, lantraser
Halvsyskonfamilj/helsyskonfamilj/vilda resurser
4. Bioinformationsanalys
● Genomomfattande associationsanalys
● Analys och screening av signifikant SNP
● Funktionell annotering av kandidatgen
5. Service Arbetsflöde
Experimentdesign
Provleverans
RNA-extraktion
Byggande av bibliotek
Sekvensering
Dataanalys
Service efter försäljning
a.Fenotyp QC
Frekvensfördelningshistogram
Fenotypstatistik
b.Associationsanalys (modell: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ plot
Manhattan Plot
| År | Tidning | IF | Titel |
| 2022 | NC | 17,69 | Genomisk grund för giga-kromosomerna och giga-genomet hos trädpionen Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7,43 | Domesticeringsfotspår förankrar genomiska regioner av agronomisk betydelse i sojabönor |
| 2018 | MP | 9.32 | Helgenomsekvensering av en världsomspännande samling av rapsaccessioner avslöjar genetisk grund för deras ekotypdivergens |
| 2022 | HR | 7,29 | Genomomfattande associationsanalys ger molekylära insikter i den naturliga variationen av vattenmelonfröstorlek |
