BMKGENE tillhandahöll rumsliga transkriptomsekvenseringstjänster för studien "STEEL möjliggör högupplöst avgränsning av spatiotemporala transkriptomiska data", som publicerades i Briefings in Bioinformatics.
Denna studie föreslog en oövervakad och mångfaldig inlärningsbaserad algoritm, Spatial Transcriptome cEll type clustering (STEEL), som identifierar domäner från rumsligt transkriptom genom att klustera pärlor som uppvisar både mycket liknande genuttrycksprofiler och nära rumsligt avstånd i form av grafer.
En omfattande utvärdering av STEEL på rumsliga transkriptomiska datamängder från 10X Visium-plattformen visar att den inte bara uppnår en hög upplösning för att karakterisera fina strukturer i mushjärnan utan också möjliggör integration av flera vävnadsobjektglas som analyserats individuellt i en större.
Med utvecklingen av rumsliga transkriptomteknologier kommer vår metod att ha stor tillämpbarhet i domänidentifiering och genuttrycksatlasrekonstruktion.
Klickhärför att lära dig mer om denna studie.
Posttid: 2023-okt-20