En viktig trädgårdsodling som skiljer navelapelsiner från andra vanliga söta apelsinsorter är närvaron av en navel på frukten.Denna egenskap är också ett viktigt kriterium för klassificeringen av söta apelsinträdgårdssorter.
BMKGENEs kunder använde BMKGENEs egenutvecklade SLAF-sekvenseringsteknologi för att genomföra en studie med titeln "Gruvgener relaterade till fruktkvalitet i söta apelsiner baserat på specifik Locus Amplified Fragment Sequencing."
Studien involverade sekvensering av 240 sötorange groddplasmaresurser med bred genetisk mångfald och olika geografiska ursprung, vilket resulterade i 497,82 Mb kortläst data.Analys av data gav 1 467 968 SNP-genotyper över hela genomet.Genom att använda Fst-analys identifierade studien 6 kandidatgener relaterade till närvaron av en navel, fruktvikt och titrerbar surhet, vilket gav en grund för riktad förbättring av söta apelsinsorter.
För storskalig populationssekvensering är specifik locus amplified fragment sequencing (SLAF) mer kostnadseffektiv och högeffektiv jämfört med helgenomsekvensering (WGS).
Klickhärför att lära dig mer om denna studie.
Posttid: Dec-05-2023