● Mycket erfaren: Över 200 000 prover har bearbetats i BMK som täcker olika provtyper, inklusive cellkultur, vävnad, kroppsvätska, etc. och över 7 000 mRNA-Seq-projekt stängda som täcker olika forskningsområden.
● Strikt kvalitetskontrollsystem: Kärnpunkter för kvalitetskontroll genom alla steg inklusive provberedning, biblioteksberedning, sekvensering och bioinformatik är under noggrann övervakning för att leverera högkvalitativa resultat.
● Flera databaser tillgängliga för funktionskommentarer och anrikningsstudier för att uppfylla olika forskningsmål.
● Eftermarknadstjänster: Eftermarknadstjänster giltiga i 3 månader efter avslutat projekt, inklusive projektuppföljning, felsökning, resultat Frågor och svar, etc.
Bibliotek | Sekvenseringsstrategi | Data rekommenderas | Kvalitetskontroll |
Poly A berikad | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotider:
Konc.(ng/μl) | Mängd (μg) | Renhet | Integritet |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Begränsad eller ingen protein- eller DNA-kontamination visas på gelen. | För växter: RIN≥6,5; För djur: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; begränsad eller ingen baslinjehöjning |
Vävnad: Vikt (torr):≥1 g
*För vävnad som är mindre än 5 mg rekommenderar vi att du skickar snabbfryst (i flytande kväve) vävnadsprov.
Cellsuspension:Cellantal = 3×106- 1×107
*Vi rekommenderar att du skickar fruset cellysat.Om cellen räknas mindre än 5×105.
Blodprover:Volym≥1 ml
Mikroorganism:Massa ≥ 1 g
Behållare: 2 ml centrifugrör (tunnfolie rekommenderas inte)
Provmärkning: Grupp+replikat t.ex. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sändning:
Bioinformatik
Eukaryot Arbetsflöde för mRNA-sekvensanalys
Bioinformatik
ØKvalitetskontroll av rådata
ØReferensgenomanpassning
ØTranskriptionsstrukturanalys
ØKvantifiering av uttryck
ØDifferentiell uttrycksanalys
ØFunktionsanteckning och berikning
1.mRNA-data Mättnadskurva
2.Differentiell uttrycksanalys-Vulcano plot
3.KEGG-anteckning på DEG
4.GO-klassificering på DEG