BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Eukaryot mRNA Sequencing-Illumina

mRNA-sekvensering möjliggör profilering av alla mRNA som transkripterats från celler under specifika förhållanden.Det är en kraftfull teknologi för att avslöja genuttrycksprofil, genstrukturer och molekylära mekanismer för vissa biologiska processer.Hittills har mRNA-sekvensering använts i stor utsträckning inom grundforskning, klinisk diagnostik, läkemedelsutveckling, etc.

Plattform: Illumina NovaSeq Plattform


Servicedetaljer

Bioinformatik

Demoresultat

Fördelar

● Mycket erfaren: Över 200 000 prover har bearbetats i BMK som täcker olika provtyper, inklusive cellkultur, vävnad, kroppsvätska, etc. och över 7 000 mRNA-Seq-projekt stängda som täcker olika forskningsområden.

● Strikt kvalitetskontrollsystem: Kärnpunkter för kvalitetskontroll genom alla steg inklusive provberedning, biblioteksberedning, sekvensering och bioinformatik är under noggrann övervakning för att leverera högkvalitativa resultat.

● Flera databaser tillgängliga för funktionskommentarer och anrikningsstudier för att uppfylla olika forskningsmål.

● Eftermarknadstjänster: Eftermarknadstjänster giltiga i 3 månader efter avslutat projekt, inklusive projektuppföljning, felsökning, resultat Frågor och svar, etc.

Exempel på krav och leverans

Bibliotek Sekvenseringsstrategi Data rekommenderas Kvalitetskontroll
Poly A berikad Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Exempelkrav:

Nukleotider:

Konc.(ng/μl)

Mängd (μg)

Renhet

Integritet

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begränsad eller ingen protein- eller DNA-kontamination visas på gelen.

För växter: RIN≥6,5;

För djur: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begränsad eller ingen baslinjehöjning

Vävnad: Vikt (torr):≥1 g
*För vävnad som är mindre än 5 mg rekommenderar vi att du skickar snabbfryst (i flytande kväve) vävnadsprov.

Cellsuspension:Cellantal = 3×106- 1×107
*Vi rekommenderar att du skickar fruset cellysat.Om cellen räknas mindre än 5×105.

Blodprover:Volym≥1 ml

Mikroorganism:Massa ≥ 1 g

Rekommenderad provleverans

Behållare: 2 ml centrifugrör (tunnfolie rekommenderas inte)

Provmärkning: Grupp+replikat t.ex. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Sändning:

  1. Torris: Proverna måste packas i påsar och grävas ner i torris.
  2. RNAstabila rör: RNA-prover kan torkas i RNA-stabiliseringsrör (t.ex. RNAstable®) och skickas i rumstemperatur.

Service Arbetsflöde

Prov QC

Experimentdesign

provleverans

Provleverans

Pilotexperiment

RNA-extraktion

Biblioteksförberedelser

Byggande av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

Service efter försäljning

Service efter försäljning


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • Bioinformatik

    wps_doc_10

    Eukaryot Arbetsflöde för mRNA-sekvensanalys

    Bioinformatik

    ØKvalitetskontroll av rådata

    ØReferensgenomanpassning

    ØTranskriptionsstrukturanalys

    ØKvantifiering av uttryck

    ØDifferentiell uttrycksanalys

    ØFunktionsanteckning och berikning

    1.mRNA-data Mättnadskurva

    3(1)

    2.Differentiell uttrycksanalys-Vulcano plot

    4(1)

    3.KEGG-anteckning på DEG

    5(1)

    4.GO-klassificering på DEG

    6(1)

    få ett citat

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: