-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq tillhandahåller genomomfattande profilering av DNA-mål för histonmodifiering, transkriptionsfaktorer och andra DNA-associerade proteiner.Den kombinerar selektiviteten hos kromatin-immunoutfällning (ChIP) för att återvinna specifika protein-DNA-komplex, med kraften hos nästa generations sekvensering (NGS) för sekvensering med hög genomströmning av det återvunna DNA:t.Dessutom, eftersom protein-DNA-komplexen återvinns från levande celler, kan bindningsställen jämföras i olika celltyper och vävnader, eller under olika förhållanden.Tillämpningar sträcker sig från transkriptionell reglering till utvecklingsvägar till sjukdomsmekanismer och vidare.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
-
Helgenomets bisulfitsekvensering
DNA-metylering vid den femte positionen i cytosin (5-mC) har en fundamental inverkan på genuttryck och cellulär aktivitet.Onormala metyleringsmönster har associerats med flera tillstånd och sjukdomar, såsom cancer.WGBS har blivit guldstandarden för att studera genomomfattande metylering vid enkelbasupplösning.
Plattform: Illumina NovaSeq6000
-
Analys för Transposas-tillgängligt kromatin med hög genomströmningssekvensering (ATAC-seq)
ATAC-seq är en sekvenseringsmetod med hög genomströmning för analys av genomomfattande kromatintillgänglighet, vilket är viktigt för global epigenetisk kontroll av genuttryck.Sekvenseringsadaptrar sätts in i öppna kromatinregioner genom hyperaktivt Tn5-transposas.Efter PCR-amplifiering konstrueras ett sekvenseringsbibliotek.Alla öppna kromatinregioner kan erhållas under ett specifikt rum-tidsförhållande, inte bara begränsat till bindningsställena för en transkriptionsfaktor eller en viss histonmodifierad region.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
DNA-metyleringsforskning har alltid varit ett hett ämne inom sjukdomsforskningen och är nära relaterad till genuttryck och fenotypiska egenskaper.RRBS är en noggrann, effektiv och ekonomisk metod för forskning om DNA-metylering.Anrikning av promotor- och CpG-öregioner genom enzymatisk klyvning (Msp I), kombinerat med Bisulfite-sekvensering, ger högupplöst DNA-metyleringsdetektion.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
