BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Illumina och BGI

Illumina sekvenseringsteknologi, baserad på Sequencing by Synthesis (SBS), är en globalt anammad NGS-innovation, ansvarig för att generera över 90 % av världens sekvenseringsdata.Principen för SBS involverar avbildning av fluorescensmärkta reversibla terminatorer när varje dNTP tillsätts och därefter klyvs för att möjliggöra inkorporering av nästa bas.Med alla fyra reversibla terminatorbundna dNTP: er närvarande i varje sekvenseringscykel, minimerar naturlig konkurrens inkorporeringsbias.Denna mångsidiga teknologi stöder både enkellästa och parade bibliotek, vilket tillgodoser en rad genomiska applikationer.Illumina-sekvenseringens förmåga och precision med hög genomströmning positionerar den som en hörnsten i genomikforskning, vilket ger forskare möjlighet att reda ut genomens krångligheter med oöverträffad detalj och effektivitet.

DNBSEQ, utvecklat av BGI, är en annan innovativ NGS-teknologi som har lyckats minska ytterligare ned sekvenseringskostnaderna och öka genomströmningen.Beredning av DNBSEQ-bibliotek involverar DNA-fragmentering, beredning av ssDNA och rullande cirkelamplifiering för att erhålla DNA-nanobollarna (DNB).Dessa laddas sedan på en fast yta och sekvenseras därefter genom kombinatorisk Probe-Anchor Synthesis (cPAS).

Vår förtillverkade bibliotekssekvenseringstjänst underlättar för kunder att förbereda sina sekvenseringsbibliotek från olika källor (mRNA, helgenom, amplikon, bland annat).Därefter kan dessa bibliotek skickas till våra sekvenseringscenter för kvalitetskontroll och sekvensering i Illumina- eller BGI-plattformar.


Servicedetaljer

Demo resultat

Funktioner

Plattformar:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten och BGI-DNB-T7

Sekvenseringslägen:PE50, PE100, PE150, PE250

Kvalitetskontroll av bibliotek före sekvensering

Sekvenseringsdataleverans och QC:leverans av QC-rapport och rådata i fastq-format efter demultiplexering och filtrering av Q30-läsningar.

 

Servicefördelar

Mångsidighet av sekvenseringstjänster:kunden kan välja att sekvensera efter körfält, flödescell eller mängd data.

Mångsidighet av plattformar:DNB-bibliotek kan överföras till Illumina-plattformar

Lång erfarenhet av Illumina sekvenseringsplattform:med tusentals stängda projekt med olika arter. 

Leverans av sekvenserings-QC-rapport:med kvalitetsmått, datanoggrannhet och övergripande prestanda för sekvenseringsprojektet.

Mogen sekvenseringsprocess:med kort handläggningstid.

Rigorös kvalitetskontroll: vi implementerar strikta kvalitetskontrollkrav för att garantera leverans av konsekvent högkvalitativa resultat.

Exempelkrav*

Partiell körfältssekvensering

Datamängd (X)

Koncentration (qPCR/nM)

Volym

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Single Lane (Illumina)

Plattform

Koncentration (qPCR/nM)

Volym

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Förutom koncentration och total mängd krävs även ett lämpligt toppmönster.

 

Kontakta oss om dina prover inte uppfyller utgångsmaterialkraven.

Service arbetsflöde

provberedning

Bibliotekets kvalitetskontroll

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Datakvalitetskontroll

Prov QC

Projekt leverans


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • Bibliotek QC rapport

    En rapport om kvaliteten på biblioteket tillhandahålls före sekvensering, bedömning av biblioteksmängd och fragmentering.

     

    Sekvenserings-QC-rapport

     

    Tabell 1. Statistik över sekvenseringsdata.

    Prov-ID

    BMKID

    Rå läser

    Rådata (bp)

    Ren läsning (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figur 1. Kvalitetsfördelning längs läsningar i varje prov

    A9

    Figur 2. Basinnehållsfördelning

    A10

    Figur 3. Fördelning av läst innehåll i sekvenseringsdata

    A11

     

    få ett citat

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: