●Plattformar:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten och BGI-DNB-T7
●Sekvenseringslägen:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kvalitetskontroll av bibliotek före sekvensering
●Sekvenseringsdataleverans och QC:leverans av QC-rapport och rådata i fastq-format efter demultiplexering och filtrering av Q30-läsningar.
●Mångsidighet av sekvenseringstjänster:kunden kan välja att sekvensera efter körfält, flödescell eller mängd data.
●Mångsidighet av plattformar:DNB-bibliotek kan överföras till Illumina-plattformar
●Lång erfarenhet av Illumina sekvenseringsplattform:med tusentals stängda projekt med olika arter.
●Leverans av sekvenserings-QC-rapport:med kvalitetsmått, datanoggrannhet och övergripande prestanda för sekvenseringsprojektet.
●Mogen sekvenseringsprocess:med kort handläggningstid.
●Rigorös kvalitetskontroll: vi implementerar strikta kvalitetskontrollkrav för att garantera leverans av konsekvent högkvalitativa resultat.
Datamängd (X) | Koncentration (qPCR/nM) | Volym |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plattform | Koncentration (qPCR/nM) | Volym |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Förutom koncentration och total mängd krävs även ett lämpligt toppmönster.
En rapport om kvaliteten på biblioteket tillhandahålls före sekvensering, bedömning av biblioteksmängd och fragmentering.
Tabell 1. Statistik över sekvenseringsdata.
Prov-ID | BMKID | Rå läser | Rådata (bp) | Ren läsning (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figur 1. Kvalitetsfördelning längs läsningar i varje prov
Figur 2. Basinnehållsfördelning
Figur 3. Fördelning av läst innehåll i sekvenseringsdata