Sequencing RNA inti tunggal

Gambar Pilihan RNA Sequencing inti tunggal

Kamajuan dina néwak sél tunggal sareng téknik konstruksi perpustakaan individu digabungkeun sareng urutan throughput tinggi ngamungkinkeun studi éksprési gén dina dasar sél-demi-sél.Éta ngamungkinkeun analisa sistem anu langkung jero sareng lengkep dina populasi sél kompléks, dimana éta umumna ngahindarkeun masking heterogénitasna ku cara nyandak rata-rata sadaya sél.

Sanajan kitu, sababaraha sél henteu cocog pikeun dijadikeun suspénsi sél tunggal, jadi métode persiapan sampel séjén - ékstraksi inti tina jaringan diperlukeun, nyaeta, inti langsung sasari tina jaringan atawa sél jeung disiapkeun kana gantung-inti tunggal pikeun single- runtuyan sél.

BMK nyadiakeun 10 × Genomics Chromium TM dumasar jasa sequencing RNA sél tunggal.Ladenan ieu seueur dianggo dina studi ngeunaan studi anu aya hubunganana sareng panyakit, sapertos diferensiasi sél imun, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, jsb.

Chip transcriptome spasial: 10 × Genomics

Platform: Platform Illumina NovaSeq

Taros Kami

Rincian Service

Bioinformatika

Hasil demo

Prinsip teknis

Isolasi inti dihontal ku 10 × Genomics Chromium TM, anu diwangun ku sistem mikrofluida dalapan saluran sareng pameuntasan ganda.Dina sistem ieu, manik gél sareng barcode sareng primer, énzim sareng inti tunggal dibungkus dina tetes minyak ukuran nanoliter, ngahasilkeun Gél Bead-in-Emulsion (GEM).Sakali GEM kabentuk, lisis sél sareng sékrési barkod dilaksanakeun dina unggal GEM.mRNA ditranskripsi balik kana molekul cDNA kalawan 10 × barcodes jeung UMI, nu salajengna tunduk kana konstruksi perpustakaan sequencing baku.

Jaringan henteu cocog pikeun persiapan gantung sél tunggal

Sél / Tissue	Alesan
Unfresh jaringan beku	Teu bisa meunangkeun organisasi seger atawa lila disimpen
Sel otot, Megakariosit, Lemak…	Diaméter sél badag teuing pikeun ngasupkeun alat
Ati…	Ripuh teuing pikeun megatkeun, teu bisa ngabedakeun sél tunggal
Sél neuron, Otak…	Leuwih sénsitip, gampang stress, bakal ngarobah hasil sequencing
Pankréas, Tiroid…	Beunghar énzim endogenous, mangaruhan produksi gantung sél tunggal

Inti tunggal vs sél tunggal

Inti tunggal	Sél tunggal
diaméter sél Unlimited	Diaméter sél: 10-40 μm
Bahanna tiasa janten jaringan beku	Bahanna kedah janten jaringan seger
Stress low sél beku	Pangobatan énzim tiasa nyababkeun réaksi setrés sél
Henteu aya sél getih beureum anu kedah dipiceun	Sél getih beureum kedah dipiceun
Nuklir nganyatakeun bioinformation	Sakabeh sél nganyatakeun bioinformation