-
Sequencing Metatranscriptome
Urutan metatranscriptome ngenalkeun ekspresi gen mikroba (duanana eukariot sareng prokariot) dina lingkungan alam (nyaéta taneuh, cai, laut, tai, sareng usus.). spésiés, analisis pengayaan fungsional gén anu dikedalkeun béda, sareng seueur deui.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Génom Jamur
Biomarker Technologies nyadiakeun survéy génom, génom rupa jeung génom pene-lengkep jamur gumantung kana tujuan panalungtikan husus.Sequencing génom, assembly jeung annotation fungsi bisa dihontal ku ngagabungkeun Next-generation sequencing + Sequencing generasi katilu pikeun ngahontal assembly génom tingkat luhur.Téknologi Hi-C ogé tiasa dianggo pikeun ngagampangkeun pangumpulan génom dina tingkat kromosom.
Platform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Platform Illumina NovaSeq
-
Pakakas
BMKCloud mangrupakeun platform bioinformatic ngarah nyadiakeun solusi hiji-eureun pikeun program génomik, nu loba dipercaya ku peneliti di sagala rupa arena kaasup médis, tatanén, lingkungan, jsb BMKCloud komitmen nyadiakeun layanan terpadu, dipercaya jeung efisien kaasup platform analisis bioinformatic jeung parabot. , sumberdaya komputasi, database publik, kursus online bioinformtic, jsb BMKCloud boga rupa parabot bioinformatic remen dipake kaasup annotation gén, parabot genetik évolusionér, ncRNA, kontrol kualitas data, assembly, alignment, ékstraksi data, mutasi, statistik, inohong generator, runtuyan analisis, jsb.
-
Baktéri Génom Lengkep
Biomarker Technologies nyayogikeun jasa urutan dina ngawangun génom lengkep baktéri kalayan gap enol.Alur kerja utama baktéri konstruksi génom lengkep ngawengku urutan generasi katilu, assembly, annotation fungsional jeung analisis bioinformatic canggih minuhan tujuan panalungtikan husus.Profil génom baktéri anu leuwih komprehensif ngamungkinkeun nembongkeun mékanisme dasar anu aya dina prosés biologisna, anu ogé tiasa masihan rujukan anu berharga pikeun panalungtikan génomik dina spésiés eukariot luhur.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
-
RNA leutik
RNA leutik mangrupikeun jinis RNA non-coding pondok kalayan panjang rata-rata 18-30 nt, kalebet miRNA, siRNA sareng piRNA.RNA leutik ieu geus sacara masif dilaporkeun aub dina sagala rupa prosés biologis kayaning degradasi mRNA, inhibisi tarjamahan, formasi heterochromatin, jsb Analisis sequencing SmallRNA geus loba dilarapkeun dina studi ngeunaan ngembangkeun sato / tutuwuhan, kasakit, virus, jsb RNA leutik. platform analisis sequencing diwangun ku analisis baku sarta pertambangan data canggih.Dina dasar data RNA-seq, analisa standar tiasa ngahontal idéntifikasi sareng prediksi miRNA, prediksi gén target miRNA, anotasi sareng analisis ekspresi.Analisis canggih ngamungkinkeun milarian sareng ékstraksi miRNA khusus, generasi diagram Venn, miRNA sareng gedong jaringan gén target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS mangrupikeun platform analisis urutan ulang génom sadayana, anu dikembangkeun dumasar kana pangalaman anu beunghar dina Biomarker Technologies.Platform anu gampang dianggo ieu ngamungkinkeun pangiriman gancang alur kerja analisis terpadu ku ngan saukur netepkeun sababaraha parameter dasar, anu cocog pikeun data sequencing DNA anu dihasilkeun tina platform Illumina sareng platform sequencing BGI.Platform ieu disebarkeun dina server komputasi kinerja luhur, anu nguatkeun analisis data anu efisien pisan dina waktos anu terbatas.Pertambangan data pribadi sayogi dumasar kana analisis standar, kalebet kueri gen mutated, desain primer PCR, jsb.
-
mRNA (Rujukan)
Transcriptome nyaéta tumbu antara informasi genetik génomik jeung proteome fungsi biologis.Regulasi tingkat transkripsi mangrupikeun mode pangaturan organisme anu paling penting sareng paling diulik.Sequencing Transcriptome tiasa ngaruntuykeun transkriptom iraha waé dina waktos atanapi dina kaayaan naon waé, kalayan résolusi anu akurat kana hiji nukléotida. Éta sacara dinamis tiasa ngagambarkeun tingkat transkripsi gen, sakaligus ngaidentipikasi sareng ngitung transkrip anu jarang sareng normal, sareng nyayogikeun inpormasi struktural. sampel transkrip husus.
Ayeuna, téknologi sequencing transcriptome parantos seueur dianggo dina agronomi, ubar sareng widang panalungtikan anu sanés, kalebet régulasi pangembangan sasatoan sareng pepelakan, adaptasi lingkungan, interaksi imun, lokalisasi gen, évolusi genetik spésiés sareng tumor sareng deteksi panyakit genetik.
-
Metagenomics (NGS)
Platform analisis ieu dirancang pikeun analisis data metagénomik shotgun dina dasar pangalaman taun.Ieu ngawengku workflow terpadu ngandung rupa-rupa analisa metagenomics ilahar diperlukeun kaasup ngolah data, studi tingkat spésiés, studi tingkat fungsi gén, metagenome binning, jsb Sajaba ti éta, parabot pertambangan data ngaropéa sadia kana workflow analisis baku, kaasup query gén jeung spésiés. , setelan parameter, ngahasilkeun inohong pribadi, jsb.
-
LncRNA
RNA non-coding anu panjang (lncRNA) mangrupikeun jinis transkrip anu panjangna langkung ti 200 nt, anu henteu tiasa kode protéin.Bukti akumulatif nunjukkeun yén sabagéan ageung lncRNAs kamungkinan pisan tiasa fungsional.Téknologi pangurutan throughput tinggi sareng alat analisa bioinformatik nguatkeun urang pikeun nembongkeun urutan lncRNA sareng inpormasi posisi sacara langkung éfisién sareng ngakibatkeun urang mendakan lncRNA kalayan fungsi pangaturan anu penting.BMKCloud reueus nyadiakeun platform analisis urutan lncRNA konsumén urang pikeun ngahontal analisis lncRNA gancang, dipercaya jeung fléksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genom-lebar (GWAS) tujuanana pikeun ngaidentipikasi varian genetik (genotip) anu aya hubunganana sareng sipat khusus (fenotip).Studi GWA nalungtik spidol genetik nyebrang genom sajumlah ageung individu sareng ngaramal asosiasi genotip-fenotip ku analisa statistik dina tingkat populasi.Resequencing sakabeh génom berpotensi manggihan sakabeh varian genetik.Gandeng jeung data phenotypic, GWAS bisa diolah pikeun ngaidentipikasi phenotype patali SNPs, QTLs jeung gén calon, nu niatna nyadangkeun beternak sato / tutuwuhan modern.SLAF mangrupakeun strategi sequencing génom saderhana dimekarkeun sorangan, nu manggihan spidol disebarkeun génom-lega, SNP.SNPs ieu, salaku spidol genetik molekular, bisa diolah pikeun studi pakaitna jeung Tret sasaran.Ieu mangrupakeun strategi ongkos-éféktif dina identifying Tret kompléks pakait variasi genetik.
-
Nanopore Full-panjangna transcriptomics
Isoform alternatif anu kompleks sareng variabel dina organisme mangrupikeun mékanisme genetik anu penting pikeun ngatur ekspresi gen sareng karagaman protéin.Idéntifikasi anu akurat ngeunaan struktur transkrip mangrupikeun dasar pikeun ulikan anu jero ngeunaan pola pangaturan éksprési gén.Platform sequencing Nanopore parantos suksés ngalaksanakeun kajian transkriptomi ka tingkat isoform.Platform analisis ieu dirancang pikeun nganalisis data RNA-Seq anu dihasilkeun dina platform Nanopore dina dasar génom rujukan, anu ngahontal analisa kualitatif sareng kuantitatif dina tingkat gen sareng tingkat transkrip.
-
sir-RNA
RNA sirkular (circular) nyaéta tipe RNA non-coding, nu anyar kapanggih maénkeun peran penting dina jaringan pangaturan aub dina ngembangkeun, résistansi lingkungan, jsb. Béda ti molekul RNA linier, misalna mRNA, lncRNA, 3' jeung 5'. tungtung circRNA ngagabung babarengan pikeun ngabentuk struktur sirkular, nu nyalametkeun aranjeunna tina nyerna exonuclease sarta leuwih stabil batan lolobana RNA linier.CircRNA geus kapanggih boga fungsi rupa-rupa dina ngatur éksprési gén.CircRNA tiasa janten ceRNA, anu ngabeungkeut miRNA sacara kompetitif, katelah spons miRNA.Platform analisis urutan CircRNA nguatkeun struktur circRNA sareng analisis ekspresi, prediksi target sareng analisa gabungan sareng jinis molekul RNA anu sanés.
