-
Urutan Immunoprecipitation Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq nyadiakeun profil génom-lega tina target DNA pikeun modifikasi histone, faktor transkripsi, sarta protéin DNA-pakait séjén.Ieu ngagabungkeun selektivitas chromatin immuno-précipitation (ChIP) pikeun cageur kompléx protéin-DNA husus, kalawan kakuatan sequencing generasi saterusna (NGS) pikeun sequencing throughput tinggi DNA pulih.Salaku tambahan, kusabab kompléx protéin-DNA pulih tina sél hirup, situs beungkeutan tiasa dibandingkeun dina jinis sél sareng jaringan anu béda, atanapi dina kaayaan anu béda.Aplikasi dibasajankeun régulasi transkripsional ka jalur pamekaran pikeun mékanisme panyakit sareng saluareun.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Metagénomic Sequencing -NGS
Metagenom nujul kana kumpulan total bahan genetik komunitas campuran organisme, kayaning metagenom lingkungan, metagenom manusa, jsb Ieu ngandung génom duanana mikroorganisme cultivatable jeung uncultivatable.Sequencing métagénomik nyaéta alat molekular anu dipaké pikeun nganalisis bahan génomik campuran sasari tina sampel lingkungan, nu nyadiakeun inpo wincik dina diversity spésiés jeung kaayaanana, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional jeung jaringan korelasi jeung faktor lingkungan.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Metagénomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics mangrupakeun alat molekular dipaké pikeun nganalisis bahan génomik dicampur sasari tina sampel lingkungan, nu nyadiakeun inpo wincik dina diversity spésiés jeung kaayaanana, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional jeung jaringan korelasi jeung faktor lingkungan, jsb Nanopore sequencing platform anyar geus diwanohkeun. pikeun studi metagénomic.Kinerja anu luar biasa dina panjang dibaca sacara umum ningkatkeun analisis metagénomik aliran handap, khususna rakitan metagénome.Ngamangpaatkeun panjang-baca, ulikan metagénomik basis Nanopore tiasa ngahontal assembly langkung kontinyu dibandingkeun jeung metagenomics shot-gun.Eta geus diterbitkeun yén metagenomics basis Nanopore hasil dihasilkeun génom baktéri lengkep jeung katutup tina microbiomes (Moss, EL, et. al.Alam Biotéh, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
Sequencing génom bisulfit sakabeh
Métilasi DNA dina posisi kalima dina sitosin (5-mC) boga pangaruh fundamental dina éksprési gén jeung aktivitas sélular.Pola methylation abnormal geus pakait sareng sababaraha kaayaan sarta panyakit, kayaning kanker.WGBS geus jadi standar emas pikeun diajar métilasi génom-lega dina resolusi basa tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Assay pikeun Transposase-Accessible Chromatin sareng High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq mangrupakeun metoda sequencing-throughput tinggi pikeun analisis aksésibilitas kromatin génom-lega, nu penting pikeun kontrol epigenetic global éksprési gén.Sequencing adapters diselapkeun kana wewengkon kromatin kabuka ku Tn5 transposase hiperaktif.Saatos amplifikasi PCR, perpustakaan sequencing diwangun.Sadaya daérah kromatin kabuka tiasa didapet dina kaayaan rohangan-waktos anu khusus, henteu ngan ukur dugi ka situs beungkeutan faktor transkripsi, atanapi daérah anu dirobih histone.
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit dina rRNA 16S sareng 18S anu ngandung daérah anu sangat konservasi sareng hiper-variabel nyaéta sidik molekul anu sampurna pikeun identifikasi organisme prokariot sareng eukariot.Ngamangpaatkeun sequencing, amplicons ieu bisa sasaran dumasar kana bagian conserved jeung wewengkon hyper-variabel bisa pinuh dicirikeun pikeun idéntifikasi mikroba contributing kana studi ngawengku analisis diversity mikroba, taksonomi, filogeni, jsb molekul tunggal real-time (SMRT). ) sequencing platform PacBio ngamungkinkeun pikeun ménta bacaan panjang akurat pisan, nu bisa nutupan amplicons full-panjangna (approx. 1,5 Kb).Panempoan anu lega ngeunaan widang genetika ningkatkeun résolusi dina anotasi spésiés dina komunitas baktéri atanapi jamur.
Platform:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing boga tujuan pikeun nembongkeun filogéni, taksonomi, jeung kaayaanana spésiés dina komunitas mikroba ku nalungtik produk PCR spidol genetik housekeeping nu ngandung duanana bagian kacida conversed jeung hypervariable.Perkenalan sidik molekular sampurna ieu ku Woeses dkk, (1977) nguatkeun profil mikrobiom bébas isolasi.Sequencing of 16S (baktéri), 18S (fungi) jeung Internal transkripsi spacer (ITS, fungi) ngamungkinkeun idéntifikasi duanana spésiés loba pisan kitu ogé spésiés langka tur unidentified.Téknologi ieu parantos janten alat anu seueur diterapkeun sareng utama dina ngaidentipikasi komposisi mikroba diferensial dina sababaraha lingkungan, sapertos sungut manusa, peujit, tai, jsb.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Baktéri sarta jamur sakabeh Génom Re-Sequencing
Pangurutan ulang sakabeh génom baktéri jeung jamur mangrupakeun alat kritis pikeun ngalengkepan génom baktéri jeung fungi dipikawanoh, kitu ogé pikeun ngabandingkeun sababaraha génom atawa peta génom organisme anyar.Penting pisan pikeun ngaruntuykeun sakabéh génom baktéri jeung fungi pikeun ngahasilkeun génom rujukan anu akurat, pikeun ngalakukeun idéntifikasi mikroba jeung studi génom komparatif séjén.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
PacBio-Panjangna 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Platform Amplicon (16S / 18S / ITS) dikembangkeun kalayan pangalaman mangtaun-taun dina analisis proyék keragaman mikroba, anu ngandung analisa dasar standar sareng analisa pribadi: analisis dasar nyertakeun eusi analisis arus utama panalungtikan mikroba ayeuna, eusi analisa beunghar sareng komprehensif, jeung hasil analisis dipidangkeun dina wangun laporan proyék;Eusi analisis pribadi rupa-rupa.Sampel tiasa dipilih sareng parameter tiasa diatur sacara fleksibel dumasar kana laporan analisis dasar sareng tujuan panalungtikan, pikeun ngawujudkeun syarat pribadi.sistem operasi Windows, basajan tur gancang.
-
PacBio-Transkriptom Panjang lengkep (Non-Referensi)
Nyandak data urutan Isoform Pasifik (PacBio) salaku input, Aplikasi ieu tiasa ngaidentipikasi sekuen transkrip panjangna (tanpa assembly).Ku pemetaan runtuyan full-panjang ngalawan génom rujukan, transkrip bisa dioptimalkeun ku gén dipikawanoh, transkrip, wewengkon coding, jsb Dina hal ieu, idéntifikasi leuwih akurat struktur mRNA, kayaning splicing alternatif, jsb, bisa dihontal.Analisis gabungan sareng data sekuensing transkrip NGS ngamungkinkeun anotasi anu langkung komprehensif sareng kuantitas anu langkung akurat dina ekspresi dina tingkat transkrip, anu sabagéan ageung pedah éksprési diferensial hilir sareng analisis fungsional.
-
Ngurangan Representasi Bisulfite Sequencing (RRBS)
Panalitian métilasi DNA sok janten topik anu panas dina panalungtikan panyakit, sareng raket patalina sareng éksprési gén sareng sipat pheno-typic.RRBS mangrupikeun metode anu akurat, efisien sareng ekonomis pikeun panalungtikan métilasi DNA.Pengayaan wilayah promotor sareng pulau CpG ku pembelahan énzimatik (Msp I), digabungkeun sareng sekuen Bisulfite, nyayogikeun deteksi métilasi DNA résolusi luhur.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan mRNA prokariot
Urutan mRNA nguatkeun profil komprehensif sadaya transkrip mRNA dina sél dina kaayaan khusus.Téknologi canggih ieu janten alat anu kuat, ngabuka profil éksprési gen anu rumit, struktur gen, sareng mékanisme molekular anu aya hubunganana sareng prosés biologis anu rupa-rupa.Diadopsi sacara lega dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, sareng pamekaran ubar, sekuen mRNA nawiskeun wawasan ngeunaan seluk-beluk dinamika sélulér sareng régulasi genetik.Ngolah sampel mRNA prokariot kami disaluyukeun pikeun transkriptom prokariot, ngalibetkeun deplesi rRNA sareng persiapan perpustakaan arah.
Platform: Illumina NovaSeq X
