-
Sequencing RNA inti tunggal
Kamajuan dina néwak sél tunggal sareng téknik konstruksi perpustakaan individu digabungkeun sareng urutan throughput tinggi ngamungkinkeun studi éksprési gén dina dasar sél-demi-sél.Éta ngamungkinkeun analisa sistem anu langkung jero sareng lengkep dina populasi sél kompléks, dimana éta umumna ngahindarkeun masking heterogénitasna ku cara nyandak rata-rata sadaya sél.
Sanajan kitu, sababaraha sél henteu cocog pikeun dijadikeun suspénsi sél tunggal, jadi métode persiapan sampel séjén - ékstraksi inti tina jaringan diperlukeun, nyaeta, inti langsung sasari tina jaringan atawa sél jeung disiapkeun kana gantung-inti tunggal pikeun single- runtuyan sél.
BMK nyadiakeun 10 × Genomics Chromium TM dumasar jasa sequencing RNA sél tunggal.Ladenan ieu seueur dianggo dina studi ngeunaan studi anu aya hubunganana sareng panyakit, sapertos diferensiasi sél imun, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, jsb.
Chip transcriptome spasial: 10 × Genomics
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Tutuwuhan / Sasatoan sakabeh Génom Sequencing
Urutan ulang génom sakabeh, ogé katelah WGS, ngamungkinkeun pikeun nembongkeun mutasi umum jeung langka dina sakabéh génom kaasup Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), jeung Copy Number Variation (CNV). ).SV ngabentuk bagian gedé tina basa variasi ti SNPs sarta boga dampak gede dina génom, nu boga pangaruh signifikan dina organisme hirup.Resequencing lila-dibaca ngamungkinkeun pikeun idéntifikasi leuwih tepat fragmen badag sarta variasi pajeulit sabab maca panjang ngajadikeun leuwih gampang kromosom nyebrang ngaliwatan wewengkon pajeulit kayaning ulang tandem, GC / AT-euyeub wewengkon, sarta wewengkon hyper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
Transcriptomics spasial nangtung di forefront inovasi ilmiah, empowering peneliti pikeun delve kana pola éksprési gén intricate dina jaringan bari preserving konteks spasial maranéhanana.Ditengah rupa-rupa platform, BMKGene geus ngembangkeun BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, boasting hijiresolusi ditingkatkeuntina 5µM, ngahontal rentang subsélular, sarta sangkansetélan resolusi multi-level.Chip S1000, nampilkeun sakitar 2 juta bintik, nganggo microwells anu dilapis ku manik-manik anu dieusian ku panyilidikan panangkepan barcode sacara spasial.Perpustakaan cDNA, diperkaya ku barcode spasial, disiapkeun tina chip S1000 teras diurutkeun dina platform Illumina NovaSeq.Kombinasi sampel spatially barcoded jeung UMIs ensures akurasi sarta spésifisitas data dihasilkeun.Atribut unik chip BMKManu S1000 perenahna dina fleksibilitasna, nawiskeun setélan résolusi multi-tingkat anu tiasa disaluyukeun sacara saé pikeun jaringan sareng tingkat detil anu béda.adaptability Ieu posisi chip salaku pilihan beredar pikeun rupa-rupa studi transcriptomics spasial, mastikeun clustering spasial tepat kalawan noise minimal.
Nganggo chip BMKManu S1000 sareng téknologi transkriptomi spasial anu sanés, panalungtik tiasa nampi pamahaman anu langkung saé ngeunaan organisasi spasial sél sareng interaksi molekular kompléks anu lumangsung dina jaringan, nyayogikeun wawasan anu berharga kana mékanisme prosés biologis dina sajumlah widang, kalebet. onkologi, neurosains, biologi developmental, imunologi jeung studi botanis.
Platform: chip BMKManu S1000 sareng Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transkriptomi spasial nyaéta téknologi canggih anu ngamungkinkeun panalungtik pikeun nalungtik pola éksprési gén dina jaringan bari ngajaga kontéks spasialna.Hiji platform kuat dina domain ieu 10x Genomics Visium gandeng jeung Illumina sequencing.Prinsip 10X Visium perenahna dina chip husus kalawan aréa newak ditunjuk dimana bagian jaringan disimpen.Wewengkon newak ieu ngandung bintik barcoded, masing-masing pakait sareng lokasi spasial unik dina jaringan.Molekul RNA anu kawengku tina jaringan teras dilabélan ku identifier molekular unik (UMI) salami prosés transkripsi sabalikna.Titik barcode sareng UMI ieu ngamungkinkeun pemetaan spasial anu tepat sareng kuantifikasi ekspresi gen dina resolusi sél tunggal.Kombinasi sampel spatially barcoded jeung UMIs ensures akurasi sarta spésifisitas data dihasilkeun.Ku ngagunakeun téknologi Transcriptomik Spatial ieu, panalungtik bisa meunangkeun pamahaman anu leuwih jero ngeunaan organisasi spasial sél jeung interaksi molekular kompléks nu lumangsung dina jaringan, nawarkeun wawasan invaluable kana mékanisme kaayaan prosés biologis dina sababaraha widang, kaasup onkologi, neurosains, biologi developmental, imunologi. , jeung studi botani.
Platform: 10X Genomics Visium sareng Illumina NovaSeq
-
Full-Panjang mRNA Sequencing-Nanopore
Bari sequencing mRNA basis NGS boga fungsi minangka alat serbaguna pikeun kuantifikasi éksprési gén, reliance na on maca pondok ngawatesan efficacy na dina analisis transcriptomic kompléks.Sequencing nanopore, di sisi séjén, migunakeun téhnologi lila-baca, sangkan urutan transkrip mRNA full-panjangna.Pendekatan ieu ngagampangkeun éksplorasi komprehensif ngeunaan splicing alternatif, fusi gen, poli-adénilasi, sareng kuantifikasi isoform mRNA.
Urutan nanopore ngandelkeun sinyal listrik-molekul tunggal nanopore sacara real-time.Dipandu ku protéin motor, DNA untaian ganda meungkeut kana protéin nanopore anu dipasang dina biofilm, ngaléngkah nalika ngaliwatan saluran nanopore dina bédana tegangan.Sinyal listrik has anu dihasilkeun ku basa anu béda dina untaian DNA dideteksi sareng diklasifikasikeun sacara real-time, ngagampangkeun urutan nukléotida anu akurat sareng kontinyu.pendekatan inovatif ieu overcomes watesan pondok-baca sarta nyadiakeun platform dinamis pikeun analisis génomik intricate, ngawengku studi transcriptomic kompléks.
Platform: Nanopore Promethion P48
-
Runtuyan mRNA panjangna pinuh -PacBio
Bari sequencing mRNA basis NGS mangrupakeun alat serbaguna pikeun quantifying éksprési gén, reliance on maca pondok ngawatesan pamakéan na dina analisis transcriptomic kompléks.Sequencing PacBio (Iso-Seq), di sisi anu sanés, ngagunakeun téknologi anu dibaca panjang, ngamungkinkeun pangurutan transkrip mRNA panjangna.Pendekatan ieu ngagampangkeun éksplorasi komprehensif ngeunaan splicing alternatif, fusi gén sareng poli-adénilasi sanaos sanés pilihan utama pikeun kuantifikasi éksprési gén, kusabab jumlah data anu diperyogikeun.
Téknologi pangurutan PacBio ngandelkeun pangurutan molekul tunggal, real-time (SMRT), nyayogikeun kaunggulan anu béda dina nangkep transkrip mRNA panjangna.Pendekatan inovatif ieu ngalibatkeun panggunaan pandu gelombang mode nol (ZMWs), sumur mikrofabrikasi anu ngamungkinkeun observasi sacara real-time kagiatan DNA polimérase nalika sekuen.Dina ZMWs ieu, polimérase DNA PacBio nyintésis untaian pelengkap DNA, ngahasilkeun bacaan panjang anu ngalangkungan sakabéh transkrip mRNA.Operasi PacBio dina modeu Circular Consensus sequencing (CCS) ningkatkeun akurasi ku sababaraha kali ngaruntuykeun molekul anu sami.Bacaan HiFi anu dihasilkeun gaduh akurasi anu dibandingkeun sareng NGS, teras nyumbang kana analisis komprehensif sareng dipercaya fitur transkriptomi kompleks.Platform: PacBio Sequel II
-
Eukariot mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA nguatkeun profil komprehensif sadaya transkrip mRNA dina sél dina kaayaan khusus.Téknologi canggih ieu janten alat anu kuat, ngabuka profil éksprési gen anu rumit, struktur gen, sareng mékanisme molekular anu aya hubunganana sareng prosés biologis anu rupa-rupa.Diadopsi sacara lega dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, sareng pamekaran ubar, sekuen mRNA nawiskeun wawasan ngeunaan seluk-beluk dinamika sélulér sareng régulasi genetik.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Non-Referensi dumasar mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA nguatkeun profil komprehensif sadaya transkrip mRNA dina sél dina kaayaan khusus.Téknologi canggih ieu janten alat anu kuat, ngabuka profil éksprési gen anu rumit, struktur gen, sareng mékanisme molekular anu aya hubunganana sareng prosés biologis anu rupa-rupa.Diadopsi sacara lega dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, sareng pamekaran ubar, sekuen mRNA nawiskeun wawasan ngeunaan seluk-beluk dinamika sélulér sareng régulasi genetik.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Long non-coding sequencing-Illumina
Long non-coding RNAs (lncRNAs) nyaéta RNA anu panjangna leuwih ti 200 nukléotida anu mibanda poténsi pangkodeuan minimal sarta mangrupa unsur pivotal dina RNA non-coding.Kapanggih dina inti sareng sitoplasma, RNA ieu maénkeun peran anu penting dina régulasi épigenetik, transkripsi, sareng pasca-transkripsi, negeskeun pentingna dina ngawangun prosés sélular sareng molekular.Urutan LncRNA mangrupikeun alat anu kuat dina diferensiasi Sél, Ontogenesis, sareng Panyakit Manusa.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Leutik RNA sequencing-Illumina
Molekul RNA (sRNA) leutik, biasana kurang ti 200 nukléotida panjangna, ngawengku microRNAs (miRNAs), RNA interfering leutik (siRNAs), jeung piwi-interacting RNAs (piRNAs).Di antara ieu, miRNAs, panjangna kira-kira 20-24 nukléotida, hususna penting pikeun peran pangaturan pivotal maranéhanana dina sagala rupa prosés sélular.Kalayan pola ekspresi spésifik jaringan sareng spésifik panggung, miRNA nunjukkeun konservasi anu luhur pikeun spésiés anu béda.
Platform: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Sirkuler RNA sequencing (circRNA-seq) nyaéta pikeun profil jeung nganalisis RNA sirkular, kelas molekul RNA nu ngabentuk loop katutup alatan kajadian splicing non-kanonik, nyadiakeun RNA ieu kalawan ngaronjat stabilitas.Bari sababaraha circRNAs geus ditémbongkeun meta salaku spons microRNAs, sequestering microRNAs sarta nyegah eta tina régulasi target mRNAs maranéhanana, circRNAs séjén bisa interaksi jeung protéin, modulate ekspresi gén, atawa boga peran dina prosés sélular.Analisis éksprési circRNA masihan wawasan kana peran pangaturan molekul ieu sareng pentingna dina sagala rupa prosés sélulér, tahap pangembangan, sareng kaayaan panyakit, nyumbang kana pamahaman anu langkung jero ngeunaan pajeulitna régulasi RNA dina kontéks éksprési gén.
-
Sequencing transcriptome sakabeh - Illumina
Sequencing transcriptome sakabeh nawiskeun pendekatan komprehensif pikeun profil molekul RNA rupa-rupa, ngawengku duanana coding (mRNA) jeung RNA non-coding (lncRNA, circRNA, sarta miRNA).Téhnik ieu ngarebut transkriptom pinuh ku sél spésifik dina waktos anu ditangtukeun, ngamungkinkeun pikeun pamahaman holistik ngeunaan prosés sélulér.Ogé kawanoh salaku "total RNA sequencing," éta boga tujuan pikeun unveil jaringan pangaturan intricate dina tingkat transcriptome, sangkan analisis di-jero kayaning competing RNA endogenous (ceRNA) jeung analisis RNA gabungan.Ieu nandaan léngkah awal pikeun karakterisasi fungsional, khususna dina ngabongkar jaringan pangaturan anu ngalibetkeun interaksi ceRNA basis circRNA-miRNA-mRNA.
