-
Metagénomic Sequencing -NGS
Metagenom nujul kana kumpulan total bahan genetik komunitas campuran organisme, kayaning metagenom lingkungan, metagenom manusa, jsb Ieu ngandung génom duanana mikroorganisme cultivatable jeung uncultivatable.Sequencing métagénomik nyaéta alat molekular anu dipaké pikeun nganalisis bahan génomik campuran sasari tina sampel lingkungan, nu nyadiakeun inpo wincik dina diversity spésiés jeung kaayaanana, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional jeung jaringan korelasi jeung faktor lingkungan.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Metagénomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics mangrupakeun alat molekular dipaké pikeun nganalisis bahan génomik dicampur sasari tina sampel lingkungan, nu nyadiakeun inpo wincik dina diversity spésiés jeung kaayaanana, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional jeung jaringan korelasi jeung faktor lingkungan, jsb Nanopore sequencing platform anyar geus diwanohkeun. pikeun studi metagénomic.Kinerja anu luar biasa dina panjang dibaca sacara umum ningkatkeun analisis metagénomik aliran handap, khususna rakitan metagénome.Ngamangpaatkeun panjang-baca, ulikan metagénomik basis Nanopore tiasa ngahontal assembly langkung kontinyu dibandingkeun jeung metagenomics shot-gun.Eta geus diterbitkeun yén metagenomics basis Nanopore hasil dihasilkeun génom baktéri lengkep jeung katutup tina microbiomes (Moss, EL, et. al.Alam Biotéh, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit dina rRNA 16S sareng 18S anu ngandung daérah anu sangat konservasi sareng hiper-variabel nyaéta sidik molekul anu sampurna pikeun identifikasi organisme prokariot sareng eukariot.Ngamangpaatkeun sequencing, amplicons ieu bisa sasaran dumasar kana bagian conserved jeung wewengkon hyper-variabel bisa pinuh dicirikeun pikeun idéntifikasi mikroba contributing kana studi ngawengku analisis diversity mikroba, taksonomi, filogeni, jsb molekul tunggal real-time (SMRT). ) sequencing platform PacBio ngamungkinkeun pikeun ménta bacaan panjang akurat pisan, nu bisa nutupan amplicons full-panjangna (approx. 1,5 Kb).Panempoan anu lega ngeunaan widang genetika ningkatkeun résolusi dina anotasi spésiés dina komunitas baktéri atanapi jamur.
Platform:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing boga tujuan pikeun nembongkeun filogéni, taksonomi, jeung kaayaanana spésiés dina komunitas mikroba ku nalungtik produk PCR spidol genetik housekeeping nu ngandung duanana bagian kacida conversed jeung hypervariable.Perkenalan sidik molekular sampurna ieu ku Woeses dkk, (1977) nguatkeun profil mikrobiom bébas isolasi.Sequencing of 16S (baktéri), 18S (fungi) jeung Internal transkripsi spacer (ITS, fungi) ngamungkinkeun idéntifikasi duanana spésiés loba pisan kitu ogé spésiés langka tur unidentified.Téknologi ieu parantos janten alat anu seueur diterapkeun sareng utama dina ngaidentipikasi komposisi mikroba diferensial dina sababaraha lingkungan, sapertos sungut manusa, peujit, tai, jsb.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Baktéri sarta jamur sakabeh Génom Re-Sequencing
Pangurutan ulang sakabeh génom baktéri jeung jamur mangrupakeun alat kritis pikeun ngalengkepan génom baktéri jeung fungi dipikawanoh, kitu ogé pikeun ngabandingkeun sababaraha génom atawa peta génom organisme anyar.Penting pisan pikeun ngaruntuykeun sakabéh génom baktéri jeung fungi pikeun ngahasilkeun génom rujukan anu akurat, pikeun ngalakukeun idéntifikasi mikroba jeung studi génom komparatif séjén.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
Sequencing Metatranscriptome
Urutan metatranscriptome ngenalkeun ekspresi gen mikroba (duanana eukariot sareng prokariot) dina lingkungan alam (nyaéta taneuh, cai, laut, tai, sareng usus.). spésiés, analisis pengayaan fungsional gén anu dikedalkeun béda, sareng seueur deui.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Génom Jamur
Biomarker Technologies nyadiakeun survéy génom, génom rupa jeung génom pene-lengkep jamur gumantung kana tujuan panalungtikan husus.Sequencing génom, assembly jeung annotation fungsi bisa dihontal ku ngagabungkeun Next-generation sequencing + Sequencing generasi katilu pikeun ngahontal assembly génom tingkat luhur.Téknologi Hi-C ogé tiasa dianggo pikeun ngagampangkeun pangumpulan génom dina tingkat kromosom.
Platform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Platform Illumina NovaSeq
-
Baktéri Génom Lengkep
Biomarker Technologies nyayogikeun jasa urutan dina ngawangun génom lengkep baktéri kalayan gap enol.Alur kerja utama baktéri konstruksi génom lengkep ngawengku urutan generasi katilu, assembly, annotation fungsional jeung analisis bioinformatic canggih minuhan tujuan panalungtikan husus.Profil génom baktéri anu leuwih komprehensif ngamungkinkeun nembongkeun mékanisme dasar anu aya dina prosés biologisna, anu ogé tiasa masihan rujukan anu berharga pikeun panalungtikan génomik dina spésiés eukariot luhur.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
