-
Urutan Immunoprecipitation Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq nyadiakeun profil génom-lega tina target DNA pikeun modifikasi histone, faktor transkripsi, sarta protéin DNA-pakait séjén.Ieu ngagabungkeun selektivitas chromatin immuno-précipitation (ChIP) pikeun cageur kompléx protéin-DNA husus, kalawan kakuatan sequencing generasi saterusna (NGS) pikeun sequencing throughput tinggi DNA pulih.Salaku tambahan, kusabab kompléx protéin-DNA pulih tina sél hirup, situs beungkeutan tiasa dibandingkeun dina jinis sél sareng jaringan anu béda, atanapi dina kaayaan anu béda.Aplikasi dibasajankeun régulasi transkripsional ka jalur pamekaran pikeun mékanisme panyakit sareng saluareun.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Sequencing génom bisulfit sakabeh
Métilasi DNA dina posisi kalima dina sitosin (5-mC) boga pangaruh fundamental dina éksprési gén jeung aktivitas sélular.Pola methylation abnormal geus pakait sareng sababaraha kaayaan sarta panyakit, kayaning kanker.WGBS geus jadi standar emas pikeun diajar métilasi génom-lega dina resolusi basa tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Assay pikeun Transposase-Accessible Chromatin sareng High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq mangrupakeun metoda sequencing-throughput tinggi pikeun analisis aksésibilitas kromatin génom-lega, nu penting pikeun kontrol epigenetic global éksprési gén.Sequencing adapters diselapkeun kana wewengkon kromatin kabuka ku Tn5 transposase hiperaktif.Saatos amplifikasi PCR, perpustakaan sequencing diwangun.Sadaya daérah kromatin kabuka tiasa didapet dina kaayaan rohangan-waktos anu khusus, henteu ngan ukur dugi ka situs beungkeutan faktor transkripsi, atanapi daérah anu dirobih histone.
-
Ngurangan Representasi Bisulfite Sequencing (RRBS)
Panalitian métilasi DNA sok janten topik anu panas dina panalungtikan panyakit, sareng raket patalina sareng éksprési gén sareng sipat pheno-typic.RRBS mangrupikeun metode anu akurat, efisien sareng ekonomis pikeun panalungtikan métilasi DNA.Pengayaan wilayah promotor sareng pulau CpG ku pembelahan énzimatik (Msp I), digabungkeun sareng sekuen Bisulfite, nyayogikeun deteksi métilasi DNA résolusi luhur.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
