Basis Nanopore Full-panjangna Transcriptome Sequencing
Sequencing nanopore ngabedakeun diri ti platform sequencing séjén, nu nukléotida dibaca langsung tanpa sintésis DNA sarta ngahasilkeun bacaan panjang dina puluhan kilobases.Ieu empowers maca-kaluar langsung tina transkrip full-panjangna jeung tackling tantangan dina studi transcriptomic.
√ Low runtuyan-spésifik bias
√ Pembacaan lengkep cDNA pikeun studi struktur gén
√ Kurang data anu diperyogikeun pikeun nutupan jumlah transkrip anu sami
√ Idéntifikasi sababaraha isoforms per gén
√ Kuantifikasi éksprési dina tingkat isoform
Pipa Bioinformatika has
Kasus Suksés Panganyarna sareng Biomarker Technologies
1. Analisis komparatif tina transkriptom panjang pinuh nembongkeun dinamika perkembangan batang Gnetum luofuense
Journal: Frontiers dina Genetika
Diterbitkeun: Mar 2021
Konci: Minion |splicing alternatif |APA |lncRNA |Transkrip anu dikedalkeun sacara béda
Baca Full-téks
2. Gerakan unidirectional RNA leutik ti pucuk ka akar dina heterografts interspésifik
Jurnal: Tutuwuhan Alam
Diterbitkeun: Januari 2021
Konci: Nanopore |Illumina |deteksi mRNA mobile pinuh-panjang
3. Analisis transcriptome full-panjang akar asparagus nembongkeun mékanisme molekular kasabaran uyah ngainduksi ku fungi mycorrhizal arbuscular.
Jurnal: Lingkungan sareng Botani Ékspérimén
Diterbitkeun: Januari 2021
Konci: Minion |Transkrip anu dikedalkeun sacara béda |Faktor transkripsi |Splicing alternatif
4. Parobahan Karakteristik Fisiologis sareng Transkriptom Panjang Mawar (Rosa chinensis) Akar sareng Daun pikeun Tanggapan Stress Halodo.
Jurnal: Tutuwuhan sareng Fisiologi Sél
Diterbitkeun: Oktober 2020
Konci: PromethION |Transkrip anu dikedalkeun sacara béda |prediksi fungsi |Isoforms spliced |TF jeung lncRNA
5. Analisis sareng perbandingan komprehensif ngeunaan PacBio sareng sekuen RNA basis nanopore tina transkriptom Arabidopsis
Jurnal: Métode tutuwuhan
Diterbitkeun: April 2020
Konci: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |alignment génom |Idéntifikasi Transkrip |splicing alternatif |SSR |LncRNA |Isoform kuantifikasi
News jeung Highlights Tujuanana pikeun ngabagi kasus suksés panganyarna sareng Biomarker Technologies, nyandak prestasi ilmiah novel ogé téknik anu diterapkeun nalika diajar.
waktos pos: Jan-08-2022