Génom
Rakitan skala kromosom sareng analisa pamotongan biomassa genom Miscanthus lutarioriparius
Urutan Nanopore |Illumina |Hi-C |RNA-sequencing |Filogéni
Dina ulikan ieu, Biomarker Technologies nyayogikeun dukungan téknis ngeunaan urutan Nanopore, rakitan génom de novo, rakitan dibantuan Hi-C, jsb.
Abstrak
Miscanthus, tutuwuhan taunan rhizomatous, boga potensi gede pikeun produksi bioenergi pikeun biomassa tinggi na toleransi stress.Urang ngalaporkeun rakitan skala kromosom tinaMiscanthus lutarioripariusgénom ku ngagabungkeun Oxford Nanopore sequencing jeung téhnologi Hi-C.Majelis 2.07-Gb nyertakeun 96.64% tina génom, sareng contig N50 tina 1.71 Mb.Runtuyan centromere jeung telomere dirakit pikeun sakabéh 19 kromosom jeung kromosom 10, masing-masing.Asal allotetraploid tina M. lutarioriparius dikonfirmasi ngagunakeun ulangan satelit centromeric.Struktur génom tetraploid sareng sababaraha susunan ulang kromosom relatif ka sorgum jelas nunjukkeun.Tandem duplikat gén tinaM. lutarioripariusfungsina enriched teu ukur dina istilah nu patali jeung réspon stress, tapi biosintésis témbok sél.Kulawarga gén anu aya hubunganana sareng résistansi panyakit, biosintésis témbok sél sareng transportasi ion logam dilegaan sareng mekar pisan.Perluasan kulawarga ieu tiasa janten dasar génomik anu penting pikeun ningkatkeun sipat anu luar biasaM. lutarioriparius.
Statistik konci tina rakitan génom
Angka.Tinjauan tina rakitan génom M. lutarioriparius
News jeung Highlights Tujuanana pikeun ngabagi kasus suksés panganyarna sareng Biomarker Technologies, nyandak prestasi ilmiah novel ogé téknik anu diterapkeun nalika diajar.
waktos pos: Jan-05-2022