-
Urutan Immunoprecipitation Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq nyadiakeun profiling génom-lega tina target DNA pikeun modifikasi histon, faktor transkripsi, sarta protéin DNA-pakait séjén.Ieu ngagabungkeun selektivitas chromatin immuno-précipitation (ChIP) pikeun cageur kompléx protéin-DNA husus, kalawan kakuatan generasi saterusna sequencing (NGS) pikeun sequencing throughput tinggi DNA pulih.Salaku tambahan, sabab kompléx protéin-DNA pulih tina sél hirup, situs beungkeutan tiasa dibandingkeun dina jinis sél sareng jaringan anu béda, atanapi dina kaayaan anu béda.Aplikasi dibasajankeun régulasi transkripsional ka jalur pamekaran pikeun mékanisme panyakit sareng saluareun.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Sequencing génom bisulfit sakabeh
Métilasi DNA dina posisi kalima dina sitosin (5-mC) boga pangaruh dasar dina éksprési gén jeung aktivitas sélular.Pola methylation abnormal geus pakait sareng sababaraha kaayaan jeung panyakit, kayaning kanker.WGBS geus jadi standar emas pikeun diajar métilasi génom-lega dina resolusi basa tunggal.
Platform: Illumina NovaSeq6000
-
Assay pikeun Transposase-Accessible Chromatin sareng High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq mangrupakeun metoda sequencing throughput tinggi pikeun analisa aksésibilitas kromatin génom-lega, nu penting pikeun kontrol epigenetic global éksprési gén.Adaptor sequencing diselapkeun kana daérah kromatin kabuka ku transposase Tn5 hiperaktif.Saatos amplifikasi PCR, perpustakaan sequencing diwangun.Sadaya daérah kromatin kabuka tiasa didapet dina kaayaan rohangan-waktos anu khusus, henteu ngan ukur dugi ka situs beungkeutan faktor transkripsi, atanapi daérah anu dirobih histone.
-
Ngurangan Representasi Bisulfite Sequencing (RRBS)
Panaliti métilasi DNA sok janten topik anu panas dina panalungtikan panyakit, sareng raket patalina sareng éksprési gén sareng sipat pheno-typic.RRBS mangrupikeun metode anu akurat, efisien sareng ekonomis pikeun panalungtikan métilasi DNA.Pengayaan wilayah promotor sareng pulau CpG ku pembelahan énzimatik (Msp I), digabungkeun sareng sekuen Bisulfite, nyayogikeun deteksi métilasi DNA résolusi luhur.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
