●Platform:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten sareng BGI-DNB-T7
●Modeu urutan:PE50, PE100, PE150, PE250
●kadali kualitas perpustakaan saméméh sequencing
●Urutan pangiriman data sareng QC:pangiriman laporan QC jeung data atah dina format fastq sanggeus demultiplexing na nyaring Q30 berbunyi.
●Versatility jasa Sequencing:nasabah bisa milih urutan ku jalur, aliran sél atawa jumlah data.
●Versatility tina platform:Perpustakaan DNB tiasa ditransfer ka platform Illumina
●Pangalaman éksténsif dina platform urutan Illumina:kalawan rébuan proyék katutup kalayan sagala rupa spésiés.
●Pangiriman laporan sequencing QC:kalawan metrics kualitas, akurasi data jeung kinerja sakabéh proyék sequencing.
●Prosés sequencing dewasa:kalayan waktos péngkolan pondok.
●Kontrol Kualitas anu ketat: urang nerapkeun syarat QC ketat pikeun ngajamin pangiriman hasil kualitas luhur konsistén.
Jumlah Data (X) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Jilid |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Platform | Konsentrasi (qPCR/nM) | Jilid |
HiSeq X Sapuluh | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Salian konsentrasi sareng jumlah total, pola puncak anu cocog ogé diperyogikeun.
A laporan ngeunaan kualitas perpustakaan disadiakeun saméméh sequencing, assessing jumlah perpustakaan, sarta fragméntasi.
Tabél 1. Statistik dina ngaruntuykeun data.
ID sampel | BMKID | Atah maca | Data Atah (bp) | Bacaan beresih (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas sapanjang maca dina unggal sampel
Gambar 2. Sebaran eusi dasar
Gambar 3. Distribusi eusi bacaan dina ngaruntuykeun data