Produk

Urutan DNA/RNA -PacBio Sequencer

DNA / RNA sequencing -PacBio Sequencer Diulas Gambar

Platform sequencing PacBio mangrupikeun platform sekuen anu dibaca panjang, anu ogé katelah salah sahiji téknologi Sequencing Generasi Katilu (TGS).Téknologi inti, molekul tunggal sacara real-time (SMRT), nguatkeun generasi bacaan kalayan panjangna puluhan kilo-basa.Dina dasar "Sequencing-by-Synthesis", resolusi nukléotida tunggal kahontal ku Zero-mode waveguide (ZMW), dimana ukur volume kawates di handapeun (situs sintésis molekul), cahayana.Sajaba ti éta, sequencing SMRT sakitu legana ngahindarkeun bias runtuyan-spésifik dina sistem NGS, sabab lolobana léngkah amplifikasi PCR henteu diperlukeun dina prosés konstruksi perpustakaan.

Platform: Sequel II, Revio

Taros Kami

Rincian Service

Hasil demo

Fitur

Dua mode sequencing on PacBio sequencer: Continuous Long Read (CLR) jeung Circular Consensus Read (CCS)

Mode Sequencing

Ukuran Perpustakaan

Data TéoritisNgahasilkeun (Per Sél)

Dasar tunggalAkurasi

Aplikasi

CLR

20 Kb, 30 Kb, jsb.

80 Gb ka 130 Gb

Kira-kira.85%

De novo, SV nelepon, jsb.

CCS

15-20 Kb

14 nepi ka 40 Gb/Sél (Sequel II)

70 nepi ka 110 Gb/Sél (Revio)

Gumantung kana sampel

Kira-kira.99%

De novo, Telepon SNP/Indel/SV, Iso-Seq,

Ngabandingkeun kinerja sarta fitur Revio na Sequel II

Sarat	Sistem Sekuel II	Sistim Revo	Naékkeun
Kapadetan luhur	8 juta ZMWs	25 juta ZMWs	3x
Tahap mandiri	1	4	4x
waktos ngajalankeun pondok	30 jam	24 jam	1,25x
30X HiFi génom manusa / taun	88	1.300	15x sakabéh

Keunggulan Service

● Leuwih 8 taun pangalaman dina platform sequencing PacBio kalawan rébuan proyék katutup jeung sagala rupa spésiés.

● Pinuh dilengkepan platform PacBio Sequencing panganyarna, Revio pikeun ngajamin throughput sequencing cukup.

● Waktos péngkolan langkung gancang, ngahasilkeun data anu langkung luhur sareng data anu langkung akurat.

● Kontribusi dina ratusan publikasi dumasar-PacBio dampak luhur.

Syarat Sampel

Tipe Sampel

Jumlah

Konsentrasi （Qubit®）

Jilid

Kasucian

Lain

DNA génomik

Gumantung kana Sarat Data

≥50 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;
OD260/230 = 1.8-2.5；
Puncak jelas dina 260 nm,euweuh contaminations

Konsentrasi kedah diukur ku Qubit sareng Qubit/Nanopore = 0.8-2.5

RNA total

≥1,2 μg

≥120 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;
OD260/230 = 0,5-2,5；euweuh contaminations

nilai RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

Alur Palayanan

Persiapan sampel

Pangwangunan perpustakaan

Sequencing

Analisis data

Pangiriman proyék

saméméhna: Pabrikan OEM Mrna Sequencing Service - Long non-coding sequencing-Illumina - Biomarker

Teras: Illumina sareng BGI

1.In-imah Data ngahasilkeun

Data dihasilkeun tina 63 sél CCS (tina 26 spésiés)

DATA-PacBio-CCS-15 Kb	Rata-rata	Max	Min	Median
Ngahasilkeun - subreads (Gb)	421.12	544.27	221.38	426.58
Ngahasilkeun - CCS(Gb)	25.93	38.59	10.86	25.43
Polimérase N50	145.651	175.430	118.118	144.689
Subreads N50	17.509	23.924	12.485	17.584
CCS N50	14.490	19.034	9.876	14.747
Rata-rata panjangna-Polimérase	67.995	89.379	49.664	66.433
Rata panjang-Subreads	15.866	21.036	11.657	16.012
Rata-rata panjangna-CCS	14.489	19.074	8.575	14.655

Data dihasilkeun tina 16 sél CLR (tina 76 spésiés)

DATA-PacBio-CLR-30Kb	Rata-rata	Max	Min	Median
Ngahasilkeun - subreads (Gb)	142.20	291.40	50.55	142.49
Polimérase N50	39.456	121.191	15.389	35.231
Subreads N50	28.490	41.012	14.430	29.063
Rata-rata panjangna-Polimérase	22.063	48.886	8.747	21.555
Rata panjang-Subreads	17.720	27.225	8.293	17.779

2. Data QC - DemoStatistik dina ngahasilkeun data

Sampel	ccs Bacaan Num	Total ccs Base (bp)	ccs Bacaan N50 (bp)	ccs Rata-rata Panjang (bp)	ccs Bacaan Pangpanjangna (bp)	Subbacaan Dasar (bp)	laju ccs(%)
PB_BMKxxx	3.444.159	54.164.122.586	15.728	15.726	36.110	863.326.330.465	6.27