circRNA sequencing-Illumina
Fitur
● depletion rRNA dituturkeun ku persiapan perpustakaan arah, sangkan sequencing data anu strand-spésifik.
● workflow Bioinformatic ngamungkinkeun circRNA prediksi jeung éksprési quantification
Keunggulan Service
●Pustaka RNA nu leuwih lengkep:kami nganggo depletion rRNA tinimbang depletion RNA linier dina persiapan pra-perpustakaan urang, mastikeun yén data sequencing ngawengku teu ukur circRNA tapi ogé mRNA jeung lncRNA, sangkan analisis gabungan on datasets ieu.
●Analisis pilihan jaringan RNA endogenous kompetitif (ceRNA).: nyadiakeun wawasan leuwih jero kana mékanisme pangaturan sélular
●Kaahlian éksténsif: kalawan catetan lagu ngolah leuwih 20.000 sampel dina BMK, ngawengku rupa-rupa jenis sampel sarta proyék lncRNA, tim kami brings kabeungharan pangalaman ka unggal proyék.
●Kontrol Kualitas anu ketat: urang nerapkeun titik kontrol inti dina sagala tahapan, ti sampel jeung persiapan perpustakaan nepi ka sequencing na bioinformatics.Ngawaskeun taliti ieu mastikeun pangiriman hasil kualitas luhur sacara konsisten.
● Rojongan Post-Penjualan: Komitmen kami ngalegaan saluareun parantosan proyék kalayan periode jasa saatos-jualan 3-bulan.Salila ieu, kami nawiskeun nurutan proyék, bantuan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
Syarat Sampel sareng Pangiriman
| Perpustakaan | Platform | data dianjurkeun | Data QC |
| Poly A enriched | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Syarat Sampel:
Nukléotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260 / 230 = 0,5-2,5 Kawates atanapi henteu aya kontaminasi protéin atanapi DNA anu dipidangkeun dina gél. | Pikeun tutuwuhan: RIN≥6.5; Pikeun sato: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; kawates atawa euweuh élévasi dasar |
● Tutuwuhan:
Akar, Batang atanapi Petal: 450 mg
Daun atawa Siki: 300 mg
Buah: 1,2 g
● Sasatoan:
Jantung atanapi peujit: 450 mg
Viscera atanapi Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atawa Kulit: 1.5g
● Artropoda:
Serangga: 9 g
Crustacea: 450 mg
● Sakabeh getih:2 pipah
● Sél: 106 sél
● Sérum jeung Plasma: 6 ml
Disarankeun Pangiriman Sampel
Wadahna: 2 ml centrifuge tube (Timah foil teu dianjurkeun)
Sampel panyiri: Grup + ulangan misalna A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Pangiriman:
1. Garing-és: Sampel kudu dipak dina kantong jeung dikubur di garing-és.
2. tabung RNAstable: sampel RNA bisa garing dina tube stabilisasi RNA (misalna RNAstable®) jeung shipped dina suhu kamar.
Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Bioinformatika
prediksi circRNA: distribusi kromosom
circRNAs Ditémbongkeun béda - plot gunung seuneuan
circRNAs Ditémbongkeun béda - clustering hirarki
Pengayaan fungsional gen host circRNA
Ngajalajah kamajuan panalungtikan anu difasilitasi ku jasa urutan circRNA BMKGene ngaliwatan kumpulan publikasi anu dikurasi.
Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 ngatur formasi circRNA jeung microRNA dimédiasi gén silencing dina carcinoma hépatocellular', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), pp. 4338-4351.Doi: 10.1038 / s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) 'X oo-responsif transcriptome mangka peran RNA133 sirkular dina résistansi kasakit ku régulasi ekspresi OsARAB dina béas', Phytopathology Panalungtikan, 5 (1), pp. 1-14.doi: 10.1186 / S42483-023-00188-8 / GAMBAR / 6.
Y, H. dkk.(2023) 'CPSF3 modulates kasaimbangan transkrip sirkular jeung linier dina carcinoma hépatocellular'.doi: 10.21203 / RS.3.RS-2418311 / V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Evaluasi komprehensif circRNAs di cardiomyopathy cirrhotic saméméh jeung sanggeus cangkok ati', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
