Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
BMKMANU S1000 Skéma Transcriptome Spasial Téknis
Keunggulan BMKMANU S1000
1) Resolusi sub-sélular: Unggal wewengkon néwak ngandung> 2 juta Barcoded Spots spasial kalayan diaméter 2.5 µm sarta jarak 5 µm antara puseur spot, ngamungkinkeun analisis transcriptome spasial kalawan resolusi sub-sélular (5 µm).
2) Analisis resolusi multi-tingkat: Analisis multi-tingkat fléksibel mimitian ti 100 μm nepi ka 5 μm pikeun ngabéréskeun fitur jaringan rupa-rupa dina resolusi optimal.
3) Profil transcriptome komprehensif: Transkrip kawengku tina sakabéh slide jaringan bisa dianalisis, tanpa watesan dina jumlah gén target jeung aréa target.
Spésifikasi Service
| Perpustakaan | Stratégi sequencing | Data Kaluaran dianjurkeun |
| Perpustakaan cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/sampel |
Syarat Sampel
| Sampel | Jumlah | Ukuran | Kualitas RNA |
| blok jaringan dipasang OCT | 2-3 blok / sampel | Kira-kira.6,8 x 6,8 x 6,8 mm3 | RIN≥7 |
Pikeun leuwih jéntré ngeunaan hidayah préparasi sampel sarta workflow jasa, mangga ngarasa Luncat ngobrol jeung aahli BMKGENE
Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
Pra-eksperimen
Barcoding spasial
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Data anu dihasilkeun ku BMKMANU S1000 dianalisis nganggo parangkat lunak "BSTMatrix", anu dirancang sacara mandiri ku BMKGENE, kalebet:
1) Generasi matriks éksprési gén
2) ngolah gambar HE
3) Cocog sareng parangkat lunak pihak katilu hilir pikeun analisa
4) Online "BSTViewer" mantuan pikeun ménta hasil visualisasi dina resolusi béda.
1.Spot clustering
2. Distribusi spasial
Note: Resolusitingkat = 13 (100 µm, ditinggalkeun); 7 (50 µm, katuhu)
3.Marker éksprési kaayaanana clustering heatmap
4. Analisis data antar-sampel
