-
PacBio-Transkriptom Panjang lengkep (Non-Referensi)
Platform Amplicon (16S / 18S / ITS) dikembangkeun kalayan pangalaman mangtaun-taun dina analisis proyék keragaman mikroba, anu ngandung analisa dasar standar sareng analisa pribadi: analisis dasar nyertakeun eusi analisa arus utama panalungtikan mikroba ayeuna, eusi analisa beunghar sareng komprehensif, jeung hasil analisis dipidangkeun dina wangun laporan proyék;Eusi analisis pribadi rupa-rupa.Sampel tiasa dipilih sareng parameter tiasa diatur sacara fleksibel dumasar kana laporan analisis dasar sareng tujuan panalungtikan, pikeun ngawujudkeun syarat pribadi.sistem operasi Windows, basajan tur gancang.
-
PacBio-Transkriptom Panjang lengkep (Non-Referensi)
Nyandak data urutan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) salaku input, Aplikasi ieu tiasa ngaidentipikasi sekuen transkrip panjangna (tanpa assembly).Ku pemetaan runtuyan full-panjang ngalawan génom rujukan, transkrip bisa dioptimalkeun ku gén dipikawanoh, transkrip, wewengkon coding, jsb Dina hal ieu, idéntifikasi leuwih akurat struktur mRNA, kayaning splicing alternatif, jsb, bisa dihontal.Analisis gabungan sareng data sekuen transkrip NGS ngamungkinkeun anotasi anu langkung komprehensif sareng kuantifikasi anu langkung akurat dina ekspresi dina tingkat transkrip, anu sabagéan ageung pedah éksprési diferensial hilir sareng analisis fungsional.
-
Toolkits
BMKCloud mangrupakeun platform bioinformatic ngarah nyadiakeun solusi hiji-eureun pikeun program génomik, nu lega dipercaya ku peneliti di sagala rupa arena kaasup médis, tatanén, lingkungan, jsb BMKCloud komitmen pikeun nyadiakeun layanan terpadu, dipercaya jeung efisien kaasup platform analisis bioinformatic jeung parabot. , sumberdaya komputasi, database umum, kursus online bioinformtic, jsb BMKCloud boga rupa parabot bioinformatic remen dipake kaasup annotation gén, parabot genetik évolusionér, ncRNA, kontrol kualitas data, assembly, alignment, ékstraksi data, mutasi, statistik, inohong generator, runtuyan analisis, jsb.
-
RNA leutik
RNA leutik mangrupikeun jinis RNA non-coding pondok kalayan panjang rata-rata 18-30 nt, kalebet miRNA, siRNA sareng piRNA.RNA leutik ieu geus massively dilaporkeun ka aub dina rupa prosés biologis kayaning degradasi mRNA, inhibisi tarjamahan, formasi heterochromatin, jsb Analisis sequencing SmallRNA geus loba dilarapkeun dina studi ngeunaan ngembangkeun sato / tutuwuhan, kasakit, virus, jsb RNA leutik. platform analisis sequencing diwangun ku analisis baku sarta pertambangan data canggih.Dina dasar data RNA-seq, analisa standar tiasa ngahontal idéntifikasi sareng prediksi miRNA, prediksi gén target miRNA, anotasi sareng analisis ekspresi.Analisis canggih ngamungkinkeun milarian sareng ékstraksi miRNA khusus, generasi diagram Venn, miRNA sareng gedong jaringan gén target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS mangrupikeun platform analisis urutan ulang génom sadayana, anu dikembangkeun dumasar kana pangalaman anu beunghar dina Biomarker Technologies.Platform anu gampang dianggo ieu ngamungkinkeun pangiriman gancang alur kerja analisis terpadu ku ngan saukur netepkeun sababaraha parameter dasar, anu cocog pikeun data sequencing DNA anu dihasilkeun tina platform Illumina sareng platform sequencing BGI.Platform ieu disebarkeun dina server komputasi kinerja luhur, anu nguatkeun analisis data anu éfisién pisan dina waktos anu terbatas.Pertambangan data pribadi sayogi dumasar kana analisis standar, kalebet kueri gen mutated, desain primer PCR, jsb.
-
mRNA (Rujukan)
Transcriptome nyaéta tumbu antara informasi genetik génomik jeung proteome fungsi biologis.Regulasi tingkat transkripsi mangrupikeun mode pangaturan organisme anu paling penting sareng paling seueur ditaliti.Sequencing Transcriptome tiasa ngaruntuykeun transkriptom iraha waé dina waktos atanapi dina kaayaan naon waé, kalayan résolusi anu akurat kana hiji nukléotida. Éta sacara dinamis tiasa ngagambarkeun tingkat transkripsi gen, sakaligus ngaidentipikasi sareng ngitung transkrip anu jarang sareng normal, sareng nyayogikeun inpormasi struktural. sampel transkrip husus.
Ayeuna, téhnologi sequencing transcriptome geus loba dipaké dina agronomi, ubar jeung widang panalungtikan séjén, kaasup régulasi ngembangkeun sato jeung tutuwuhan, adaptasi lingkungan, interaksi imun, lokalisasi gen, évolusi genetik spésiés jeung tumor sarta deteksi kasakit genetik.
-
Metagenomics (NGS)
Platform analisis ieu dirancang pikeun analisis data metagénomik shotgun dina dasar pangalaman taun.Ieu ngawengku workflow terpadu ngandung rupa-rupa analisa metagenomics ilahar diperlukeun kaasup ngolah data, studi tingkat spésiés, studi tingkat fungsi gén, metagenome binning, jsb Sajaba ti éta, parabot pertambangan data ngaropéa sadia kana workflow analisis baku, kaasup query gén jeung spésiés. , setelan parameter, ngahasilkeun inohong pribadi, jsb.
-
LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) mangrupikeun jinis transkrip anu panjangna langkung ti 200 nt, anu henteu tiasa kode protéin.Bukti akumulatif nunjukkeun yén sabagéan ageung lncRNAs kamungkinan pisan tiasa fungsional.Téknologi pangurutan throughput tinggi sareng alat analisa bioinformatik nguatkeun urang pikeun nembongkeun urutan lncRNA sareng inpormasi posisi langkung éfisién sareng ngakibatkeun urang mendakan lncRNA kalayan fungsi pangaturan anu penting.BMKCloud reueus nyayogikeun platform analisis urutan lncRNA pikeun ngahontal analisis lncRNA anu gancang, dipercaya sareng fleksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genom-lebar (GWAS) tujuanana pikeun ngaidentipikasi varian genetik (genotype) anu aya hubunganana sareng ciri khusus (fenotip).Panaliti GWA nalungtik spidol genetik meuntas genom sajumlah ageung individu sareng ngaramal asosiasi genotip-fenotip ku analisa statistik dina tingkat populasi.Resequencing sadayana génom berpotensi tiasa mendakan sadaya varian genetik.Gandeng jeung data phenotypic, GWAS bisa diolah pikeun ngaidentipikasi phenotype patali SNPs, QTLs jeung gén calon, nu niatna nyadangkeun beternak sato / tutuwuhan modern.SLAF mangrupakeun strategi sequencing génom disederhanakeun timer dimekarkeun, nu manggihan spidol disebarkeun génom-lega, SNP.SNPs ieu, salaku spidol genetik molekular, bisa diolah pikeun studi pakaitna jeung Tret sasaran.Ieu mangrupakeun strategi ongkos-éféktif dina identifying Tret kompléks pakait variasi genetik.
-
Nanopore transcriptomics panjangna pinuh
Isoform alternatif anu kompleks sareng variabel dina organisme mangrupikeun mékanisme genetik anu penting pikeun ngatur ekspresi gen sareng karagaman protéin.Idéntifikasi anu akurat ngeunaan struktur transkrip mangrupikeun dasar pikeun ulikan anu jero ngeunaan pola pangaturan éksprési gén.Platform sequencing Nanopore parantos hasil ngalaksanakeun kajian transkriptomi ka tingkat isoform.Platform analisis ieu dirancang pikeun nganalisis data RNA-Seq anu dihasilkeun dina platform Nanopore dina dasar génom rujukan, anu ngahontal analisa kualitatif sareng kuantitatif dina tingkat gen sareng tingkat transkrip.
