● Sababaraha strategi sequencing sadia pikeun tujuan panalungtikan béda
● Baktéri génom lengkep jeung 0 Gap dijamin.
● Kacida ngalaman dina assembly génom baktéri kalawan leuwih 10.000 génom lengkep dirakit.
● Tim rojongan teknis sanggeus-diobral profésional minuhan kaperluan panalungtikan leuwih husus.
SequencingStratégi | Perpustakaan | Kualitas dijamin | Diperkirakeun waktos péngkolan |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Gap | 30 poé |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● kadali kualitas data atah
● Génom assembly
● Analisis komponén génom
● annotation fungsi gén
● Analisis génomik komparatif
Pikeunékstrak DNA:
Tipe Sampel | Jumlah | Konsentrasi | Kasucian |
ékstrak DNA | > 2 ug | > 20 ng/μl | OD260 / 280 = 1,6-2,5 |
Pikeun sampel jaringan:
Jenis sampel | Disarankeun perlakuan sampel | gudang sampel sarta kiriman |
Bakteri | Titénan baktéri dina mikroskop jeung ngumpulkeun baktéri dina fase éksponénsial maranéhanana Mindahkeun budaya baktéri (ngandung approx. 3-4.5e9 sél) kana 1,5 atawa 2 ml eppendorf.(Terus dina es) Centrifuge tabung pikeun 1 mnt dina 14000 g pikeun ngumpulkeun baktéri jeung miceun supernatant taliti Tutup tabung sareng bekukeun baktéri dina nitrogén cair sahenteuna sahenteuna 30 menit.Simpen tabung dina kulkas -80 ℃. | Freeze sampel dina nitrogén cair pikeun 3-4 jam tur nyimpen dina nitrogén cair atawa -80 derajat pikeun reservasi jangka panjang.pengiriman sampel kalawan és garing diperlukeun. |
1.Circos génom baktéri
2.Coding prediksi gén
3.Analisis génomics komparatif: tangkal filogenetik