За цртање топлотне мапе користи се фиока топлотне карте која може филтрирати, нормализовати и кластерисати матричне податке. Углавном се користи за кластер анализу нивоа експресије гена између различитих узорака.
Прикључивање биолошких функција секвенцама у ФАСТА датотеци поравнавањем секвенци са базом података, укључујући НР, КЕГГ, ЦОГ, СвиссПрот, ТрЕМБЛ, КОГ, Пфам.
БЛАСТ (Басиц Лоцал Алигнмент Сеарцх Тоол) је алгоритам и програм за проналажење региона са сличним биолошким секвенцама.Он упоређује ове секвенце са базама података секвенци и израчунава статистичку значајност.БЛАСТ се састоји од четири типа алата заснованих на типу секвенце: бластн, ластп, бластк и тбластн.