Производи

Секвенцирање РНК са једним језгром

Истакнута слика секвенцирања РНК са једним језгром

Напредак у хватању једне ћелије и техника изградње индивидуалне библиотеке у комбинацији са секвенционирањем високе пропусности омогућава студије експресије гена на бази ћелије по ћелију.Омогућава дубљу и потпунију системску анализу сложених ћелијских популација, у којој се у великој мери избегава маскирање њихове хетерогености узимајући просек свих ћелија.

Међутим, неке ћелије нису погодне за претварање у једноћелијску суспензију, па су потребне друге методе припреме узорака – екстракција језгра из ткива, односно, језгро се директно екстрахује из ткива или ћелије и припрема у једнонуклеусну суспензију за једноструке ћелије. секвенцирање ћелија.

БМК пружа 10× Геномицс ЦхромиумТМ услугу секвенцирања једноћелијске РНК.Ова услуга се широко користи у студијама о студијама везаним за болести, као што су диференцијација имуних ћелија, хетерогеност тумора, развој ткива итд.

Чип просторног транскриптома: 10× Геномика

Платформа: Иллумина НоваСек платформа

Контактирајте нас

Детаљи услуге

Биоинформатика

Демо Ресултс

Технички принцип

Изолација језгара се постиже помоћу 10× Геномицс ЦхромиумТМ, који се састоји од осмоканалног микрофлуидног система са двоструким укрштањима.У овом систему, перле гела са бар кодовима и прајмером, ензими и једно језгро су инкапсулирани у капи уља величине нанолитара, стварајући гел перле у емулзији (ГЕМ).Када се формира ГЕМ, у сваком ГЕМ-у се врши лиза ћелије и ослобађање бар кодова.мРНК се реверзно транскрибују у молекуле цДНК са 10× бар кодовима и УМИ, који су даље подложни конструкцији стандардне библиотеке секвенцирања.

Ткиво није погодно за припрему једноћелијске суспензије

Ћелија / ткиво	Разлог
Несвеже замрзнуто ткиво	Није могуће добити свеже или дуго сачуване организације
Мишићне ћелије, мегакариоцити, масноће…	Пречник ћелије је превелик за улазак у инструмент
Јетра…	Превише крхка да би се сломила, неспособна да разликује појединачне ћелије
Неуронска ћелија, мозак…	Осетљивији, лакши за стрес, промениће резултате секвенцирања
Панкреас, штитна жлезда…	Богат ендогеним ензимима, утиче на производњу суспензије појединачних ћелија

Једно језгро против једне ћелије

Једно језгро	Једна ћелија
Неограничен пречник ћелије	Пречник ћелије: 10-40 μм
Материјал може бити замрзнуто ткиво	Материјал мора бити свеже ткиво
Низак стрес замрзнутих ћелија	Третман ензимима може изазвати реакцију на ћелијски стрес
Не морају се уклањати црвена крвна зрнца	Црвена крвна зрнца треба уклонити
Нуклеарна експресија биоинформација	Цела ћелија изражава биоинформацију