Редукована заступљеност бисулфитног секвенцирања (РРБС)
Спецификације услуге
Платформа: НоваСек платформа, ПЕ150
Тип библиотеке: 200-400бп инсерт бисулфитом третирана ДНК библиотека
Стратегија секвенцирања: упарени крај 150 бп
Препоручени излаз података: 10 Гб необрађених података/узорак
Захтеви за узорке
Количина ДНК: ≥ 2уг
Концентрација ДНК:≥ 20нг/μл.
Чистоћа: ОД260/280 = 1,8 до 2,0 без деградације или контаминације РНК
Биоинформатичка анализа
Ток рада услуге
Испорука узорка
Изградња библиотеке
Секуенцинг
Анализа података
Услуге након продаје
a.Референтна статистика поравнања генома
Статистика мапирања гласи
Sстатистика дубине секвенцирања и покривености Ц места
Aкумулирана покривеност
Dефикасност гутања сваког узорка
b.Детекција места метилације
Списак нивоа метилације на месту Ц
BС конверзија
Mетиловани цитозин
Расподела нивоа метилације
c.Мапа метилације
Gеноме-виде
Gеноме елемент
d.Поређење нивоа метилације између узорака
Pаирвисе Корелација ЦГ метилације
PЦА-ЦГ метилација
Cсјај ЦГ метилације
d.Диференцијална анализа метилације
Sстатистика ДМР
ДМР расподела дужине
Hједи мапу
DМР дистрибуција у циљаном региону
