-
БСА
Булкед Сегрегант Аналисис платформа се састоји од стандардне анализе у једном кораку и напредне анализе са прилагођеним подешавањем параметара.БСА је техника која се користи за брзу идентификацију генетских маркера повезаних са фенотипом.Главни ток рада БСА садржи: 1. одабир две групе јединки са изузетно супротним фенотиповима;2. удруживање ДНК, РНК или СЛАФ-сек (развијено од Биомаркер-а) свих појединаца да би се формирала два дела ДНК;3. идентификовање диференцијалних секвенци у односу на референтни геном или између њих, 4. предвиђање кандидата повезаних региона помоћу ЕД и СНП-индекс алгоритма;5. Функционална анализа и обогаћивање гена у регионима кандидатима, итд. Напредније истраживање података укључујући скрининг генетских маркера и дизајн прајмера су такође доступни.
-
Ампликон (16С/18С/ИТС)
Амплицон (16С/18С/ИТС) платформа је развијена са дугогодишњим искуством у анализи пројекта микробне разноликости, која садржи стандардизовану основну анализу и персонализовану анализу: основна анализа покрива главни садржај анализе актуелних микробних истраживања, садржај анализе је богат и свеобухватан, а резултати анализе су представљени у форми пројектних извештаја;Садржај персонализоване анализе је разнолик.Узорци се могу бирати и параметри могу бити флексибилно подешени у складу са основним извештајем анализе и сврхом истраживања, како би се реализовали персонализовани захтеви.Виндовс оперативни систем, једноставан и брз.
-
Еволуциона генетика
Еволуциона генетика је препуна услуга секвенцирања дизајнирана за пружање свеобухватног тумачења еволуционих информација датих материјала на основу генетских варијација, укључујући СНП, ИнДелс, СВ и ЦНВ.Пружа све фундаменталне анализе потребне за описивање еволуционих промена и генетских карактеристика популација, као што су структура популације, генетски диверзитет, филогенски односи, итд. Такође садржи студије о протоку гена, које омогућавају процену ефективне величине популације, времена дивергенције.
-
Цомпаративе Геномицс
Компаративна геномика буквално значи упоређивање комплетних секвенци и структура генома различитих врста.Ова дисциплина има за циљ откривање еволуције врста, функције гена, регулаторног механизма гена на нивоу генома идентификацијом структура секвенци и елемената који су се сачували или диференцирали међу различитим врстама.Типична компаративна студија геномике укључује анализе у породици гена, еволуционом развоју, дупликацији целог генома, селективном притиску итд.
-
Еволуциона генетика
Платформа за популацијску и еволуциону генетичку анализу је успостављена на основу огромног искуства акумулираног у оквиру БМК Р&Д тима годинама.То је алат који је прилагођен кориснику, посебно за истраживаче који се не баве биоинформатиком.Ова платформа омогућава основну основну анализу везану за еволуциону генетику, укључујући конструкцију филогенетског стабла, анализу неравнотеже веза, процену генетичке разноврсности, анализу селективног прегледа, анализу сродства, ПЦА, анализу структуре популације, итд.
-
Склоп генома заснован на Хи-Ц
Хи-Ц је метода дизајнирана да ухвати конфигурацију хромозома комбиновањем сондирања интеракција заснованих на близини и секвенцирања високе пропусности.Верује се да је интензитет ових интеракција у негативној корелацији са физичком раздаљином на хромозомима.Према томе, Хи-Ц подаци би могли да усмеравају груписање, редослед и оријентацију склопљених секвенци у нацрту генома и да их усидре на одређени број хромозома.Ова технологија омогућава склапање генома на нивоу хромозома у одсуству генетске мапе засноване на популацији.Сваки појединачни геном треба Хи-Ц.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа / ДНБСЕК
-
Секвенцирање генома биљака/животиња Де Ново
Де Новосеквенцирање се односи на изградњу целог генома врсте коришћењем технологија секвенцирања, нпр. ПацБио, Нанопоре, НГС, итд., у одсуству референтног генома.Изванредно побољшање дужине читања технологије секвенцирања треће генерације донело је нове могућности у склапању сложених генома, као што су они са високом хетерозиготношћу, високим односом репетитивних региона, полиплоидима, итд. Са дужином читања на нивоу десетина килобаза, ова очитавања секвенцирања омогућавају решавање репетитивних елемената, региона са абнормалним садржајем ГЦ и других веома сложених региона.
Платформа: ПацБио Секуел ИИ /Нанопоре ПрометхИОН П48/ Иллумина НоваСек платформа
-
Секвенцирање целог егзома човека
Секвенцирање целог егзома (ВЕС) се сматра економичном стратегијом секвенцирања за идентификацију мутација које изазивају болест.Иако егзони заузимају само око 1,7% целокупног генома, он директно представља профил укупних функција протеина.У људском геному је пријављено да се више од 85% мутација повезаних са болешћу јавља у региону који кодира протеине.
БМКГЕНЕ нуди свеобухватне и флексибилне услуге секвенцирања целог егзома човека са различитим стратегијама хватања егзона које су доступне за испуњавање различитих истраживачких циљева.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
Специфично локусно појачано секвенцирање фрагмената (СЛАФ-Сек)
Генотипизација високе пропусности, посебно на великој популацији, је фундаментални корак у студијама генетских асоцијација, који пружа генетску основу за откривање функционалних гена, еволуциону анализу, итд. ) се уводи како би се минимизирали трошкови секвенцирања по узорку, а да би се одржала разумна ефикасност у откривању генетских маркера.Ово се обично постиже издвајањем рестрикционог фрагмента унутар датог опсега величине, који се назива библиотека редуковане репрезентације (РРЛ).Секвенцирање фрагмента појачаног специфичног локуса (СЛАФ-Сек) је саморазвијена стратегија за СНП генотипизацију са или без референтног генома.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа -
Иллумина и БГИ
Иллумина технологија секвенцирања, заснована на Секуенцинг би Синтхесис (СБС), је глобално прихваћена НГС иновација, одговорна за генерисање преко 90% података о секвенцирању у свету.Принцип СБС-а укључује снимање флуоресцентно обележених реверзибилних терминатора како се сваки дНТП додаје, а затим се цепа да би се омогућило уграђивање следеће базе.Са сва четири реверзибилна терминатор-везана дНТП-а присутна у сваком циклусу секвенцирања, природна конкуренција минимизира пристрасност инкорпорације.Ова свестрана технологија подржава библиотеке са једним читањем и библиотеке са упареним крајевима, задовољавајући низ геномских апликација.Могућности високе пропусности и прецизност секвенцирања Иллумина га постављају као камен темељац у истраживању геномике, оснажујући научнике да разоткрију замршености генома са неуспоредивим детаљима и ефикасношћу.
ДНБСЕК, коју је развио БГИ, је још једна иновативна НГС технологија која је успела да додатно смањи трошкове секвенцирања и повећа пропусност.Припрема ДНБСЕК библиотека укључује фрагментацију ДНК, припрему ссДНК и амплификацију котрљајућих кругова да би се добиле ДНК нанокуглице (ДНБ).Они се затим стављају на чврсту површину и затим секвенцирају комбинаторном синтезом сонде и сидра (цПАС).
Наша унапред направљена услуга секвенцирања библиотека олакшава клијентима да припреме своје библиотеке секвенцирања из различитих извора (мРНА, цео геном, ампликон, између осталог).Након тога, ове библиотеке могу бити испоручене у наше центре за секвенцирање ради контроле квалитета и секвенцирања на Иллумина или БГИ платформама.
