-
Секвенцирање имунопреципитације хроматина (ЦхИП-сек)
ЦхИП-Сек обезбеђује профилисање ДНК циљева на нивоу генома за модификацију хистона, факторе транскрипције и друге протеине повезане са ДНК.Комбинује селективност имунопреципитације хроматина (ЦхИП) за обнављање специфичних комплекса протеин-ДНК, са снагом секвенцирања следеће генерације (НГС) за секвенционирање високе пропусности обновљене ДНК.Поред тога, пошто се комплекси протеин-ДНК добијају из живих ћелија, места везивања се могу упоредити у различитим типовима ћелија и ткивима, или под различитим условима.Примене се крећу од регулације транскрипције до развојних путева до механизама болести и даље.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
Секвенцирање бисулфита целог генома
Метилација ДНК на петој позицији у цитозину (5-мЦ) има фундаментални утицај на експресију гена и ћелијску активност.Абнормални обрасци метилације су повезани са неколико стања и болести, као што је рак.ВГБС је постао златни стандард за проучавање метилације на нивоу генома у резолуцији једне базе.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
Тест за хроматин приступачан транспозази са секвенцирањем високог протока (АТАЦ-сек)
АТАЦ-сек је високопропусна метода секвенцирања за анализу доступности хроматина у целом геному, што је важно за глобалну епигенетску контролу експресије гена.Адаптери за секвенцирање се убацују у отворене регионе хроматина хиперактивном Тн5 транспозазом.Након ПЦР амплификације, конструише се библиотека секвенцирања.Сви отворени региони хроматина могу се добити под одређеним просторно-временским условима, не само ограниченим на места везивања транскрипционог фактора, или одређеног региона модификованог хистоном.
-
Редукована заступљеност бисулфитног секвенцирања (РРБС)
Истраживање метилације ДНК одувек је било врућа тема у истраживању болести и уско је повезано са експресијом гена и фенотипским особинама.РРБС је прецизан, ефикасан и економичан метод за истраживање метилације ДНК.Обогаћивање региона промотера и ЦпГ острва ензимским цепањем (Мсп И), комбиновано са секвенцирањем бисулфита, обезбеђује детекцију метилације ДНК високе резолуције.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
