Хигхлигхтс
На овом двосатном вебинару, велика нам је част што смо позвали шест стручњака из области геномике усева.Наши говорници ће дати детаљну интерпретацију две студије о геному ражи, које су недавно објављене наПриродна генетика:
1. Склапање генома на нивоу хромозома пружа увид у биологију, еволуцију и агрономски потенцијал ражи
2. Висококвалитетни склоп генома наглашава карактеристике генома ражи и агрономски важне гене
Такође, драго нам је што имамо вишег научника за истраживање и развој компаније Биомаркер Тецхнологиес да подели своје искуство у де ново склапању генома.
Дневни ред
09:00 по средњеевропском времену
Поздравне речи
Зхенг Хонг-кун
Оснивач и извршни директор Биомаркер Тецхнологиес
Денг Ксинг-ванг
Председник Школе за напредне пољопривредне науке Пекиншког универзитета
09:15 ам
Побољшање побољшања ражи, тритикалеа и пшенице коришћењем висококвалитетне референтне секвенце генома
На овом вебинару, проф. Ванг нам је дао свеобухватна ажурирања о тренутном статусу истраживања генома тритицеае и показао успех и пробој два изузетна рада на студијама генома ражи, која су недавно објављена на Натуре Генетицс и представљају цело истраживање групе које воде и доприносе у радовима.
09:25 ам
Геномика житарица @ ИПК Гатерслебен
Житне траве племена Тритицеае биле су главни извор хране у умереним регионима, који се дуго сматрао жариштем у побољшању усева и узгоју.Међу свим култивисаним врстама, ово племе је познато по својим изузетно сложеним геномским карактеристикама укључујући велике величине генома, висок садржај ТЕ, полиплоидију, итд. На овој сесији, проф. Нилс Стеин нам је дао општи увод о ИПК Гатерслебен и тренутном статусу житарица геномиц ресеарцх@ИПК Гатерслебен.
09:35 ам
Склапање генома на нивоу хромозома пружа увид у биологију, еволуцију и агрономски потенцијал ражи
Др М Тимотхи Рабанус-Валлаце, Лајбниц институт за биљну генетику и истраживање планова усева (ИПК)Раж (Сецале цереале Л.) је култура житарица која је изузетно отпорна на климу, која се у великој мери користи за производњу побољшаних сорти пшенице путем интрогресивне хибридизације, и поседује цео репертоар гена неопходних за омогућавање хибридног оплемењивања.Раж је алогамна и тек недавно припитомљена, што култивисаној ражи даје приступ разноврсном и искористивом дивљем генском фонду.Да бисмо додатно побољшали агрономски потенцијал ражи, произвели смо скуп са ознакама на скали хромозома од 7,9 Мбп генома ражи и опсежно потврдили његов квалитет користећи скуп молекуларно генетских ресурса.Ми демонстрирамо примену овог ресурса са широким спектром истраживања.Представљамо налазе о непотпуној генетској изолацији култивисане ражи од дивљих сродника, механизмима структурне еволуције генома, отпорности на патогене, толеранцији на ниске температуре, системима контроле плодности у хибридном оплемењивању и предностима приноса од интрогресије ражи и пшенице.
10:05 ујутро
Висококвалитетни склоп генома истиче карактеристике генома ражи и агрономски важне гене
Раж је вредан прехрамбени и крмни усев, важан генетски ресурс за побољшање пшенице и тритикалеа и незаменљив материјал за ефикасна упоредна истраживања геномике трава.Овде смо секвенцирали геном Веининг ражи, елитне кинеске сорте ражи.Сакупљени контиги (7,74 Гб) чинили су 98,47% процењене величине генома (7,86 Гб), са 93,67% контига (7,25 Гб) додељених седам хромозома.Понављајући елементи су чинили 90,31% састављеног генома.У поређењу са претходно секвенцираним геномима Тритицеае, ретротранспозони Даниела, Сумаиа и Сумана показали су снажну експанзију у ражи.Даље анализе Веининговог склопа бацају ново светло на дупликације гена у целом геному и њихов утицај на гене биосинтезе скроба, физичке организације сложених локуса проламина, карактеристике експресије гена које су у основи ране особине главе, и наводне хромозомске регионе и локусе у ражи повезане са припитомљавањем.Ова секвенца генома обећава да ће убрзати геномику и студије оплемењивања ражи и сродних усева житарица.
10:35 ујутро
Изазови, решења и будућност за склапање генома де ново
Геном високог квалитета је основа геномске студије.Иако је брзи развој секвенцирања и алгоритма омогућио много једноставније и ефикасније састављање генома, захтеви за тачност и потпуност склапања такође расту са продубљивањем истраживачких циљева.У овом говору ћу разговарати о актуелним популарним технологијама у склапању генома са неколико успешних случајева и бацити поглед на будући развој.
Време поста: Јан-08-2022