Секвенцирање транскриптома пуне дужине засновано на нанопорама
Секвенцирање нанопора се разликује од других платформи за секвенцирање по томе што се нуклеотиди читају директно без синтезе ДНК и генерише дуга очитавања на десетинама килобаза.Ово омогућава директно читање транскрипта у пуној дужини и суочавање са изазовима у транскриптомским студијама.
√ Ниска пристрасност специфична за секвенцу
√ Читање цДНК пуне дужине за студије структуре гена
√ Потребно је мање података за покривање истог броја транскрипата
√ Идентификација више изоформа по гену
√ Квантификација експресије на нивоу изоформе
Типични биоинформатички цевовод
Најновији успешни случајеви са Биомаркер технологијама
1. Упоредне анализе транскриптома пуне дужине откривају динамику развоја стабла Гнетум луофуенсе
Часопис: Границе у генетици
Објављено: март 2021
Кључне речи: МинИОН |Алтернативно спајање |АПА |лнцРНА |Диференцијално изражени транскрипти
Прочитајте цео текст
2. Једносмерно кретање малих РНК од изданака до корена у интерспецифичним хетерографтима
Часопис: Природа Биљке
Објављено: јануар 2021
Кључне речи: Нанопоре |Иллумина |детекција мобилне мРНА пуне дужине
3. Целокупна транскриптомска анализа корена шпаргле открива молекуларни механизам толеранције соли изазван арбускуларним микоризним гљивама
Часопис: Еколошка и експериментална ботаника
Објављено: јануар 2021
Кључне речи: МинИОН |Диференцијално изражени транскрипти |Транскрипцијски фактори |Алтернативно спајање
4. Промене физиолошких карактеристика и транскриптом целе дужине корена и листова руже (Роса цхиненсис) као одговор на стрес од суше
Часопис: Физиологија биљака и ћелија
Објављено: октобар 2020
Кључне речи: ПрометхИОН |Диференцијално изражени транскрипти |Функционално предвиђање |Спојене изоформе |ТФ и лнцРНА
5. Анализа и свеобухватно поређење ПацБио и секвенцирања РНК на бази нанопора транскриптома Арабидопсис
Часопис: Плант Метход
Објављено: април 2020
Кључне речи: ГридИОН |ПрометхИОН |ПацБио Секуел |Иллумина НоваСек |Поравнање генома |Идентификација транскрипта |Алтернативно спајање |ССР |ЛнцРНА |Квантификација изоформе
Вести и најважније ствари има за циљ да подели најновије успешне случајеве са Биомаркер Тецхнологиес, ухвати нова научна достигнућа, као и истакнуте технике примењене током студије.
Време поста: Јан-08-2022