МИЦРОБИАЛ
Компатибилност бактерија и имобилизација са биоугљем побољшали су разградњу тебуконазола, састав и функционисање микробиома земљишта
Секвенцирање 16С ампликона пуне дужине |ПацБио ХиФи |Алфа разноврсност |Бета разноврсност
У овој студији, секвенцирање 16С ампликона пуне дужине од стране ПацБио и биоинформатичке анализе су обезбеђене од стране Биомаркер Тецхнологиес.
Хигхлигхтс
Тебуконазолом имобилисане бактерије које разграђују тебуконазол Алцалигенес фаецалис ВЗ-2 проучаване су на ефикасност биоразградње и утицај на земљиште контаминирано тебуконазолом у поређењу са слободним деградирајућим сојем ВЗ-2.
1. ВЗ-2 имобилисан биоугљем показао је ефикаснију деградацију тебуконазола у поређењу са слободним ВЗ-2 смањењем полуживота тебуконазола у земљишту са 18,7 дана на 13,3 дана.
2. ВЗ-2 имобилисан биоугљем је био у стању да обнови активности микробних ензима у земљишту, укључујући уреазу, дехидрогеназу и инвертазу, итд.
3. Микробни профил у земљишту третираном биоугљем имобилисаном ВЗ-2 одређен секвенцирањем пуне дужине 16С снажно подржава да овај систем може да поврати здравље тла побољшањем структуре бактеријске заједнице под контаминацијом тебуконазолом.
Експеримент (везано за секвенцирање)
Груписање: ЦК: Природно земљиште;Т: Земљиште напуњено тебуконазолом;С: Тебуконазол садржи земљиште са слободним сојем ВЗ-2;БЦ: Тебуконазол је садржао земљиште са биоугљем;БЦС: Тебуконазол је садржао земљиште са биоугљем имобилизованим ВЗ-2.
Узимање узорака: Укупна екстракција ДНК земљишта појачана 16С рДНК прајмерима
27Ф (5′-АГАГТТТГАТЦЦТГГЦТЦАГ-3′) и 1492Р (5′-ГГТТАЦЦТТГТТАЦГА),представља 16С рДНК пуне дужине
Платформа за секвенцирање: ПацБио РС ИИ
Стратегија секвенцирања: ЦЦС ХИФИ чита
Анализа података:БМКЦлоудБиоинформатичка платформа чини златну рибицу одличним системом генетског модела за физиологију и еволуцију риба.
Резултат
Структура микробне заједнице земљишта одређена је секвенцирањем 16С рДНК.ОТУ богатство и индекс алфа разноликости, укључујући Цхао1, Аце, Сханнон и Симпсон индексе су процењени да би се открила разноликост врста у сваком систему.Након 60 дана инкубације, сви индекси су показали сличан тренд, односно тебуконазол би могао да изазове смањење богатства врста и разноврсности у земљишту.Међутим, додавањем соја ВЗ-2, заједница бактерија у земљишту је делимично опорављена у погледу богатства и разноврсности.Уочена је ограничена разлика између БЦ, БЦС и ЦК, што указује да би биоугље и ВЗ-2 имобилисан биоугљем могли ефикасно да поврате биолошко здравље земљишта.
Метода непондерисане групе у пару са аритметичким срединама (УПГМА) је примењена у овој студији да би се показала бета разноликост међу групама.Као што је приказано на следећој слици, БЦ, БСЦ и ЦК деле сличнији образац микробног састава у поређењу са групом Т и С, што даље указује да би увођење биоугља у биоремедијацију земљишта контаминираног тебуконазолом могло у великој мери олакшати опоравак микробне заједнице у тлу.
Фигура.УПГМА груписање бактеријске заједнице на нивоу типа под различитим третманом
Референце
Сун, Тонг, ет ал.„Бактеријска компатибилност и имобилизација са биоугљем побољшали су разградњу тебуконазола, састав и функционисање микробиома земљишта.Јоурнал оф Хазардоус Материалс398 (2020): 122941.
Вести и најважније ствари има за циљ да подели најновије успешне случајеве са Биомаркер Тецхнологиес, ухвати нова научна достигнућа, као и истакнуте технике примењене током студије.
Време поста: Јан-08-2022