ГЕНОМ
Састављање на скали хромозома и анализа генома усјева биомасе Мисцантхус лутариорипариус
Секвенцирање нанопора |Иллумина |Хи-Ц |РНА-секвенцирање |Филогенија
У овој студији, Биомаркер Тецхнологиес је пружио техничку подршку за Нанопоре секвенцирање, де ново састављање генома, Хи-Ц асистирано састављање итд.
Апстрактан
Мисцантхус, ризоматозна вишегодишња биљка, има велики потенцијал за производњу биоенергије због своје високе биомасе и отпорности на стрес.Извештавамо о скупу на скали хромозомаМисцантхус лутариорипариусгеном комбиновањем Окфорд Нанопоре секвенцирања и Хи-Ц технологија.Склоп од 2,07 Гб покрива 96,64% генома, са контигом Н50 од 1,71 Мб.Секвенце центромера и теломера су састављене за свих 19 хромозома и хромозома 10, респективно.Алотетраплоидно порекло М. лутариорипариус је потврђено коришћењем центромерних сателитских понављања.Тетраплоидна структура генома и неколико хромозомских преуређивања у односу на сирак су јасно приказани.Тандем дупликати генаМ. лутариорипариусфункционално су обогаћене не само у смислу одговора на стрес, већ и биосинтезе ћелијског зида.Породице гена које се односе на отпорност на болести, биосинтезу ћелијског зида и транспорт металних јона су у великој мери проширене и еволуиране.Проширење ових породица може бити важна геномска основа за побољшање изузетних особинаМ. лутариорипариус.
Кључна статистика склапања генома
Фигура.Преглед склопа генома М. лутариорипариус
Вести и најважније ствари има за циљ да подели најновије успешне случајеве са Биомаркер Тецхнологиес, ухвати нова научна достигнућа, као и истакнуте технике примењене током студије.
Време поста: Јан-05-2022