Студија асоцијација на нивоу генома (ГВАС) има за циљ идентификацију генетских варијанти (генотипа) које су повезане са специфичним особинама (фенотипом).ГВА студије истражују генетске маркере који прелазе цео геном великог броја индивидуа и предвиђају повезаност генотип-фенотип статистичком анализом на нивоу популације.Поновно секвенцирање целог генома може потенцијално открити све генетске варијанте.У комбинацији са фенотипским подацима, ГВАС се може обрадити да би се идентификовали СНП-ови, КТЛ-ови и гени кандидати у вези са фенотипом, што снажно подржава савремени узгој животиња/биљки.СЛАФ је саморазвијена поједностављена стратегија секвенцирања генома, која открива дистрибуиране маркере широм генома, СНП.Ови СНП-ови, као молекуларни генетски маркери, могу се обрадити за студије асоцијације са циљаним особинама.То је исплатива стратегија у идентификацији сложених особина повезаних генетских варијација.