Анализа асоцијација на нивоу генома
1. Предности услуге
● Бројни пројектни случајеви: од свог оснивања 2009. године, БМКГЕНЕ је завршио стотине пројеката врста у истраживању ГВАС популације, помогао истраживачима да објаве више од 100 чланака, а кумулативни фактор утицаја је достигао 500.
● Професионални аналитичари.
● Кратак циклус анализе.
● Прецизно прикупљање података.
2. Спецификације услуге
| Тип | Популациона скала | Стратегија секвенцирања и дубина |
| СЛАФ-ГВАС | Број узорка ≥200 | Величина генома < 400М, са реф-геномом, препоручује се ВГС |
| Величина генома ≤ 1Г, 100К ознаке и 10Кс | ||
| 1Г ≤ Величина генома ≤ 2Г, 200К ознаке и 10Кс | ||
| Величина генома > 2Г, 300К ознаке и 10Кс | ||
| ВГС-ГВАС | Број узорка ≥200 | 10Кс за сваки узорак |
3. Избор материјала
Различите сорте, подврсте, ландрасе/генебанке/мешовите породице/дивљи ресурси
Различите сорте, подврсте, ландрасе
Породица са полубратом / породица са пуним братом / дивљи ресурси
4. Анализа биоинформација
● Анализа асоцијација на нивоу генома
● Анализа и скрининг значајног СНП-а
● Функционална анотација гена кандидата
5. Ток рада услуге
Дизајн експеримента
Испорука узорка
Екстракција РНК
Изградња библиотеке
Секуенцинг
Анализа података
Услуге након продаје
а.Фенотип КЦ
Хистограм расподеле фреквенције
Статистика фенотипа
б.Анализа асоцијације (модел: ГЕММА, ФаСТ-ЛММ, ЕММАКС)
КК Плот
Манхаттан Плот
| Година | Јоурнал | IF | Наслов |
| 2022 | NC | 17.69 | Геномска основа гига-хромозома и гига-генома дрвећа божура Паеониа остии |
| 2015 | NP | 7.43 | Отисци припитомљавања усидре геномске регионе од агрономског значаја у соји |
| 2018 | MP | 9.32 | Ресеквенционисање целог генома светске колекције семена уљане репице открива генетску основу њихове дивергенције екотипа |
| 2022 | HR | 7.29 | Анализа повезаности на нивоу генома пружа молекуларни увид у природну варијацију величине семена лубенице |
