Једна важна хортикултурна карактеристика која разликује пупчане поморанџе од других уобичајених слатких сорти наранџе је присуство пупка на плоду.Ова карактеристика је такође важан критеријум за класификацију хортикултурних сорти слатке наранџе.
БМКГЕНЕ-ови клијенти су користили БМКГЕНЕ-ову саморазвијену СЛАФ технологију секвенцирања како би спровели студију под називом „Гени за рударење у вези са квалитетом воћа у слатким наранџама на основу секвенцирања специфичних локуса појачаног фрагмента.“
Студија је укључивала секвенционирање 240 извора гермплазме слатке наранџе са широким генетским диверзитетом и различитим географским пореклом, што је резултирало са 497,82 Мб кратко прочитаних података.Анализа података је дала 1.467.968 СНП генотипова у целом геному.Применом Фст анализе, студија је идентификовала 6 гена кандидата који се односе на присуство пупка, масу плода и титрабилну киселост, пружајући основу за циљано побољшање сорти слатке наранџе.
За популацијско секвенционирање великих размера, секвенционирање фрагмената са појачаним локусом (СЛАФ) је исплативије и ефикасније у поређењу са секвенцирањем целог генома (ВГС).
Кликнитеовдеда сазнате више о овој студији.
Време поста: 05.12.2023