Удубите се у потенцијал проучавања дивљих различитих истраживачких врста, што је пример кључног случаја клијената БМКГЕНЕ.Недавно објављен у овогодишњем издању Плант Биотецхнологи Јоурнал, чланак под насловом „Геном дивље хевее брасилиенсис на нивоу хромозома: Оснаживање узгоја уз помоћ генома и откривање виталних локуса за повећан принос гуме“ стоји као вредна референца.
Бразилско дрво каучука (Хевеа брасилиенсис) је високо као кључни извор природне гуме.Током прошлог века, традиционалне методологије узгоја изазвале су изузетан шестоструки пораст у производњи гуме.Ипак, основна генетска основа одговорна за потенцијално повећање приноса гуме остаје загонетна.
Ова студија је започела конструисање генома на нивоу хромозома за дрво дивље гуме, користећи синергију Нанопоре секвенцирања дугог читања, Иллумина НГС секвенцирања и Хи-Ц технологије.
Паралелно, скуп од 147 ресурса гермплазме, који обухватају варијације високог приноса, дивље сојеве и сродне врсте, састављен је за свеобухватно поновно секвенцирање целог генома (ВГС) користећи Иллумина платформу.Подаци о секвенцирању који су уследили су подвргнути ригорозној популационо-генетичкој анализи, омогућавајући дисекцију структуре популације, разноликости и неравнотеже веза.Ова анализа је расветлила варијације припитомљавања међу популацијама.
Даља истраживања су обухватила анализу која је обухватала Фст, π, Тајимов Д и ЛД, са циљем да открије сигнале селекције који произилазе из побољшаног приноса латекса, посебно фокусирајући се на Викамове клонове.
Кулминирајући анализом асоцијација на нивоу генома (ГВАС), маркери повезани са особинама приноса и накнадно генима повезаним са приносом су прецизирани.Иницијална валидација је открила карактеристичне транскрипционе активности код различитих мутаната за два ЕРФ гена, пружајући прелиминарни увид у њихов функционални значај.Даље потврђивање је предвиђено у оквиру предстојећих истраживања.
БМКГЕНЕ се поноси што доприноси опсежном редоследу читавог генома ове велике популације, заједно са значајном улогом у биоинформатичкој анализи.Наше огромно искуство обухвата НГС/ТГС секвенцирање и мултиомичку биоинформатичку анализу у низу од 1000+ врста.Радујемо се могућностима партнерства са вама на вашим предстојећим пројектима.
Кликните овде дасазнајте више о овој студији
Време поста: 29.08.2023