●Платформе:Иллумина НоваСек 6000, НоваСек, ХиСек Кс Тен и БГИ-ДНБ-Т7
●Режими секвенцирања:ПЕ50, ПЕ100, ПЕ150, ПЕ250
●Контрола квалитета библиотека пре секвенцирања
●Редослед испоруке података и КЦ:испорука КЦ извештаја и необрађених података у фастк формату након демултиплексирања и филтрирања К30 читања.
●Разноврсност услуга секвенцирања:купац може да изабере секвенцу по траци, проточној ћелији или количини података.
●Разноврсност платформи:ДНБ библиотеке се могу пренети на Иллумина платформе
●Велико искуство на Иллумина платформи за секвенцирање:са хиљадама затворених пројеката са разним врстама.
●Испорука секвенционалног КЦ извештаја:са метриком квалитета, прецизношћу података и укупним перформансама пројекта секвенцирања.
●Процес зрелог секвенцирања:са кратким временом преокрета.
●Ригорозна контрола квалитета: примењујемо строге захтеве за контролу квалитета како бисмо гарантовали испоруку конзистентно висококвалитетних резултата.
Количина података (Кс) | Концентрација (кПЦР/нМ) | Волуме |
Кс ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 20 μл |
50 Гб ≤ Кс < 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 20 μл |
Кс ≥ 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 20 μл |
Платформа | Концентрација (кПЦР/нМ) | Волуме |
ХиСек Кс Тен | ≥ 2 нМ | ≥ 20 μл |
НоваСек 6000 СП | ≥ 1 нМ | ≥ 25 μл |
НоваСек 6000 С4 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 μл |
НоваСек Кс | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 μл |
БГИ-ДНБСЕК-Т7 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 μл |
Поред концентрације и укупне количине, потребан је и одговарајући образац пикова.
Извештај о квалитету библиотеке се даје пре секвенцирања, процене количине библиотеке и фрагментације.
Табела 1. Статистика података о секвенцирању.
ИД узорка | БМКИД | Сирова читања | Необрађени подаци (бп) | Чиста очитавања (%) | К20(%) | К30(%) | ГЦ(%) |
Ц_01 | БМК_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
Ц_02 | БМК_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Слика 1. Расподела квалитета дуж очитавања у сваком узорку
Слика 2. Дистрибуција основног садржаја
Слика 3. Дистрибуција прочитаног садржаја у подацима секвенцирања