1) Субћелијска резолуција: Свака област хватања је садржала >2 милиона просторних тачака са бар кодом пречника 2,5 µм и размака од 5 µм између центара тачака, омогућавајући анализу просторног транскриптома са субћелијском резолуцијом (5 µм).
2) Анализа резолуције на више нивоа: Флексибилна анализа на више нивоа у распону од 100 μм до 5 μм за решавање различитих карактеристика ткива при оптималној резолуцији.
3) Свеобухватно профилисање транскриптома: Транскрипти снимљени са целог слајдова ткива могу се анализирати, без ограничења на број циљних гена и циљно подручје.
Библиотека | Стратегија секвенцирања | Препоручује се излаз података |
С1000 цДНК библиотека | БМКМАНУ С1000-Иллумина ПЕ150 | 60Гб/узорак |
Узорак | Број | Величина | Квалитет РНК |
Блок ткива уграђен у ОЦТ | 2-3 блока/узорак | Прибл.6,8к6,8к6,8 мм3 | РИН≥7 |
За више детаља о упутствима за припрему узорака и току рада услуге, слободно разговарајте са аБМКГЕНЕ експерт
Подаци које генерише БМКМАНУ С1000 анализирају се коришћењем софтвера „БСТМатрик“, који је независно дизајнирао БМКГЕНЕ, укључујући:
1) Генерисање матрице генске експресије
2) ХЕ обрада слике
3) Компатибилан са софтвером треће стране за анализу
4) Онлине „БСТВиевер“ помаже да се добију резултати визуелизације у различитим резолуцијама.
1.Спот груписање
2.Просторни распоред
Nоте: Резолуцијалевел=13 (100 µм, лево); 7 (50 µм, јел тако)
3. Хемијска мапа обиља израза маркера
4. Анализа података међу узорцима