Sirtari i hartës së nxehtësisë përdoret për vizatimin e hartës së nxehtësisë, i cili mund të filtrojë, normalizojë dhe grumbullojë të dhënat e matricës. Përdoret më së shumti për analizën grupore të nivelit të shprehjes së gjeneve midis mostrave të ndryshme.
Bashkëngjitja e funksioneve biologjike me sekuencat në skedarin FASTA duke rreshtuar sekuencat në bazën e të dhënave, duke përfshirë NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) është një algoritëm dhe program për të gjetur rajone me sekuenca biologjike të ngjashme.Ai i krahason këto sekuenca me bazat e të dhënave të sekuencës dhe llogarit rëndësinë statistikore.BLAST përbëhet nga katër lloje mjetesh bazuar në llojin e sekuencës: blastn, lastp, blastx dhe tblastn.