Efikasitet i lartë i zbulimit të shënuesve- Teknologjia e renditjes me performancë të lartë ndihmon SLAF-Seq në zbulimin e qindra mijëra etiketave brenda të gjithë gjenomit.
Varësia e ulët nga gjenomi- Mund të aplikohet te speciet me ose pa gjenom referencë.
Dizajn fleksibël i skemës- Tretja me një enzimë, me dy enzimë, me shumë enzima dhe lloje të ndryshme enzimash, të gjitha mund të zgjidhen për të përmbushur qëllime ose specie të ndryshme kërkimore.Vlerësimi paraprak në silikon përdoret për të siguruar një dizajn optimal të enzimës.
Tretje enzimatike efikase- Paraeksperimenti u krye për të optimizuar kushtet, gjë që e bën eksperimentin formal të qëndrueshëm dhe të besueshëm.Efikasiteti i grumbullimit të fragmenteve mund të arrijë mbi 95%.
Etiketat SLAF të shpërndara në mënyrë të barabartë- Etiketat SLAF shpërndahen në mënyrë të barabartë në të gjitha kromozomet në masën më të madhe, duke arritur një mesatare prej 1 SLAF për 4 kb.
Shmangia efektive e përsëritjeve- Sekuenca e përsëritur në të dhënat SLAF-Seq është reduktuar në më pak se 5%, veçanërisht në speciet me nivel të lartë përsëritjesh, si gruri, misri, etj.
Përvojë e gjerë-Mbi 2000 projekte të mbyllura SLAF-Seq mbi qindra lloje që mbulojnë bimë, gjitarë, zogj, insekte, akuaorganizma etj.
Rrjedha e punës bioinformatike e zhvilluar vetë- Një rrjedhë pune e integruar bioinformatike për SLAF-Seq u zhvillua nga BMKGENE për të siguruar besueshmërinë dhe saktësinë e rezultatit përfundimtar.
Platforma | Konk.(ng/gl) | Total (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Vëllimi>15μl) | 1,6-2,5 |
Thellësia e renditjes: 10X/Tag
Madhësia e gjenomit | Etiketat e rekomanduara SLAF |
< 500 Mb | 100K ose WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 K |
1 Gb -2 Gb | 200 K |
Gjenoma gjigante ose komplekse | 300 - 400 mijë |
Aplikacionet
| Rekomanduar Shkalla e Popullsisë
| Strategjia dhe thellësia e renditjes
| |
Thellesi
| Numri i etiketës
| ||
GWAS
| Numri i mostrës ≥ 200
| 10X
|
Sipas madhësia e gjenomit
|
Evolucioni gjenetik
| Individët e secilit nëngrupi ≥ 10; mostrat totale ≥ 30
| 10X
|
Enë: tub centrifuge 2 ml
Për shumicën e mostrave, ne rekomandojmë që të mos ruhen në etanol.
Etiketimi i mostrës: Mostrat duhet të jenë të etiketuara qartë dhe identike me formularin e informacionit të mostrës së dorëzuar.
Dërgesa: Akull i thatë: Mostrat duhet së pari të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.
1. Statistikat e rezultatit të hartës
2. Zhvillimi i shënuesit SLAF
3. Shënimi i variacionit
viti | Ditar | IF | Titulli | Aplikacionet |
2022 | Komunikimet e natyrës | 17.694 | Baza gjenomike e giga-kromozomeve dhe giga-gjenomit të bozhures së pemës Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
2015 | Fitolog i ri | 7.433 | Gjurmët e zbutjes ankorojnë rajone gjenomike me rëndësi agronomike në sojë | SLAF-GWAS |
2022 | Gazeta e Kërkimeve të Avancuara | 12.822 | Introgresione artificiale të gjenomit të Gossypium barbadense në G. hirsutum zbulojnë lokacione superiore për përmirësimin e njëkohshëm të cilësisë dhe rendimentit të fibrave të pambukut tipare | SLAF-Genetika evolucionare |
2019 | Bimë molekulare | 10.81 | Analiza gjenomike e popullsisë dhe Asambleja De Novo zbulojnë origjinën e Weedy Orizi si një lojë evolucionare | SLAF-Genetika evolucionare |
2019 | Gjenetika e Natyrës | 31.616 | Sekuenca e gjenomit dhe diversiteti gjenetik i krapit të zakonshëm, Cyprinus carpio | SLAF-Harta e lidhjes |
2014 | Gjenetika e Natyrës | 25.455 | Gjenomi i kikirikut të kultivuar ofron njohuri për kariotipet e bishtajoreve, poliploidet evolucioni dhe zbutja e të korrave. | SLAF-Harta e lidhjes |
2022 | Revista e Bioteknologjisë së Bimëve | 9.803 | Identifikimi i ST1 zbulon një përzgjedhje që përfshin autostop të morfologjisë së farës dhe përmbajtjen e vajit gjatë zbutjes së sojës | Zhvillimi SLAF-Marker |
2022 | Revista Ndërkombëtare e Shkencave Molekulare | 6.208 | Identifikimi dhe zhvillimi i shënuesve të ADN-së për një Grurë-Leymus mollis 2Ns (2D) Zëvendësimi dizomik i kromozomeve | Zhvillimi SLAF-Marker |