BMKCloud Log in
条形 banner-03

Produktet

Sekuenca e fragmenteve të përforcuara me vendndodhje specifike (SLAF-Seq)

Gjenotipizimi me performancë të lartë, veçanërisht në popullatën në shkallë të gjerë, është një hap themelor në studimet e asociacionit gjenetik, i cili siguron bazën gjenetike për zbulimin funksional të gjenit, analizën evolucionare, etj. Në vend të ri-sekuencës së thellë të të gjithë gjenomit, sekuenca e reduktuar e përfaqësimit të gjenomit (RRGS ) është futur për të minimizuar koston e renditjes për mostër, duke ruajtur efikasitetin e arsyeshëm në zbulimin e shënuesve gjenetikë.Kjo zakonisht arrihet duke nxjerrë fragmentin kufizues brenda diapazonit të caktuar të madhësisë, i cili quhet bibliotekë e reduktuar e përfaqësimit (RRL).Sekuenca e fragmenteve të amplifikuara me vendndodhje specifike (SLAF-Seq) është një strategji e zhvilluar vetë për gjenotipizimin e SNP me ose pa një gjenom referimi.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq


Detajet e Shërbimit

Rezultatet e demonstrimit

Publikime të zgjedhura

Detajet e Shërbimit

Skema Teknike

111

Rrjedha e punës

流程图

Avantazhet e Shërbimit

Efikasitet i lartë i zbulimit të shënuesve- Teknologjia e renditjes me performancë të lartë ndihmon SLAF-Seq në zbulimin e qindra mijëra etiketave brenda të gjithë gjenomit.

Varësia e ulët nga gjenomi- Mund të aplikohet te speciet me ose pa gjenom referencë.

Dizajn fleksibël i skemës- Tretja me një enzimë, me dy enzimë, me shumë enzima dhe lloje të ndryshme enzimash, të gjitha mund të zgjidhen për të përmbushur qëllime ose specie të ndryshme kërkimore.Vlerësimi paraprak në silikon përdoret për të siguruar një dizajn optimal të enzimës.

Tretje enzimatike efikase- Paraeksperimenti u krye për të optimizuar kushtet, gjë që e bën eksperimentin formal të qëndrueshëm dhe të besueshëm.Efikasiteti i grumbullimit të fragmenteve mund të arrijë mbi 95%.

Etiketat SLAF të shpërndara në mënyrë të barabartë- Etiketat SLAF shpërndahen në mënyrë të barabartë në të gjitha kromozomet në masën më të madhe, duke arritur një mesatare prej 1 SLAF për 4 kb.

Shmangia efektive e përsëritjeve- Sekuenca e përsëritur në të dhënat SLAF-Seq është reduktuar në më pak se 5%, veçanërisht në speciet me nivel të lartë përsëritjesh, si gruri, misri, etj.

Përvojë e gjerë-Mbi 2000 projekte të mbyllura SLAF-Seq mbi qindra lloje që mbulojnë bimë, gjitarë, zogj, insekte, akuaorganizma etj.

Rrjedha e punës bioinformatike e zhvilluar vetë- Një rrjedhë pune e integruar bioinformatike për SLAF-Seq u zhvillua nga BMKGENE për të siguruar besueshmërinë dhe saktësinë e rezultatit përfundimtar.

 

Specifikimet e Shërbimit

 

Platforma

Konk.(ng/gl)

Total (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(Vëllimi>15μl)

1,6-2,5

Shënim: Tre mostra, secila me tre skema enzimash, do të kryhen për para-eksperiment.

Strategjia e rekomanduar e renditjes

Thellësia e renditjes: 10X/Tag

Madhësia e gjenomit

Etiketat e rekomanduara SLAF

< 500 Mb

100K ose WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 Gb -2 Gb

200 K

Gjenoma gjigante ose komplekse

300 - 400 mijë

 

Aplikacionet

 

Rekomanduar

Shkalla e Popullsisë

 

Strategjia dhe thellësia e renditjes

 

Thellesi

 

Numri i etiketës

 

GWAS

 

Numri i mostrës ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

Sipas

madhësia e gjenomit

 

Evolucioni gjenetik

 

Individët e secilit

nëngrupi ≥ 10;

mostrat totale ≥ 30

 

10X

 

Dorëzimi i mostrës së rekomanduar

Enë: tub centrifuge 2 ml

Për shumicën e mostrave, ne rekomandojmë që të mos ruhen në etanol.

Etiketimi i mostrës: Mostrat duhet të jenë të etiketuara qartë dhe identike me formularin e informacionit të mostrës së dorëzuar.

Dërgesa: Akull i thatë: Mostrat duhet së pari të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.

Rrjedha e punës së shërbimit

Shembull QC
Eksperiment pilot
Eksperiment SLAF
Përgatitja e Bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes

Shembull QC

Eksperiment pilot

SLAF-eksperiment

Përgatitja e Bibliotekës

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Shërbimet pas shitjes


  • E mëparshme:
  • Tjetër:

  • 1. Statistikat e rezultatit të hartës

    imazh 1

    A1

    2. Zhvillimi i shënuesit SLAF

    A2

    3. Shënimi i variacionit

    A3

    viti

    Ditar

    IF

    Titulli

    Aplikacionet

    2022

    Komunikimet e natyrës

    17.694

    Baza gjenomike e giga-kromozomeve dhe giga-gjenomit të bozhures së pemës

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    Fitolog i ri

    7.433

    Gjurmët e zbutjes ankorojnë rajone gjenomike me rëndësi agronomike në

    sojë

    SLAF-GWAS

    2022

    Gazeta e Kërkimeve të Avancuara

    12.822

    Introgresione artificiale të gjenomit të Gossypium barbadense në G. hirsutum

    zbulojnë lokacione superiore për përmirësimin e njëkohshëm të cilësisë dhe rendimentit të fibrave të pambukut

    tipare

    SLAF-Genetika evolucionare

    2019

    Bimë molekulare

    10.81

    Analiza gjenomike e popullsisë dhe Asambleja De Novo zbulojnë origjinën e Weedy

    Orizi si një lojë evolucionare

    SLAF-Genetika evolucionare

    2019

    Gjenetika e Natyrës

    31.616

    Sekuenca e gjenomit dhe diversiteti gjenetik i krapit të zakonshëm, Cyprinus carpio

    SLAF-Harta e lidhjes

    2014

    Gjenetika e Natyrës

    25.455

    Gjenomi i kikirikut të kultivuar ofron njohuri për kariotipet e bishtajoreve, poliploidet

    evolucioni dhe zbutja e të korrave.

    SLAF-Harta e lidhjes

    2022

    Revista e Bioteknologjisë së Bimëve

    9.803

    Identifikimi i ST1 zbulon një përzgjedhje që përfshin autostop të morfologjisë së farës

    dhe përmbajtjen e vajit gjatë zbutjes së sojës

    Zhvillimi SLAF-Marker

    2022

    Revista Ndërkombëtare e Shkencave Molekulare

    6.208

    Identifikimi dhe zhvillimi i shënuesve të ADN-së për një Grurë-Leymus mollis 2Ns (2D)

    Zëvendësimi dizomik i kromozomeve

    Zhvillimi SLAF-Marker

    të marrë një kuotë

    Shkruani mesazhin tuaj këtu dhe na dërgoni

    Na dërgoni mesazhin tuaj: